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问题 老师您好,在经过您的2024转录代谢培训班后,我自己运行WGCNA是出现卡住的问题

...在这块,请问老师这是什么原因啊,再有想请问老师如何筛选用来做WGCNA的转录组和代谢组数据啊,有具体方法吗,谢谢老师

文章 项目管理工具到底有什么用?

...方便和有效的。这个功能的价值在于能够帮助项目管理人分配任务,还能计算支出。 每个项目经理在设置资源的时候都会考虑到成本问题,他会意识到整个项目的成本和各部分占用的资源是否恰当。因此,在软件开发过程中...

文章 SCI期刊选择困难症有治了!推荐一款选刊神器!速领!

...置见下图。 设置好以上参数后,点击下方Find journals开始筛选期刊,结果如下图,Edit your search下还可以继续修改筛选参数;再下方是筛选出的期刊列表,信息也很直观。 点击具体期刊可以进一步查看该期刊信息,如下图,展示...

文章 ncbi sra数据批量下载

...如下,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/操作也简单,直接搜索project ID号,就可以了 然后选择自己想要的直接下载就行 得到的文件直接传给prefetch,类似 prefetch --option-file sra_ids.txt 2,我这边网络不知道咋回事,进刚才那个页...

问题 老师,使用非ensemble数据库的蛋白质序列和基因组染色体fasta文件脚本要怎么进行修改呢?

...从其他数据库下载了pep和toplevel的文件, 在除重复的hmmer搜索的转录本ID,多个转录本ID保留一个作为基因的代表的时候,得到了异常的结果,请问我是应该如何修改脚本,或者整理来自其他数据库的序列信息呢?

文章 用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

...[ -n "$identifier" ]; then # 创建对应的文件夹,若文件夹存在则不报错 mkdir -p "$identifier" # 根据文件后缀判断文件类型并进行链接 if [[ $file == *barcodes.tsv.gz ]]; then ln -s "$(realpath "$file")" "$identifier/barcodes.tsv...

文章 linux生物信息软件安装管理工具conda使用

...令conda install isoseq3 #如果不知道软件名字,以及版本可以搜索conda search isoseq #安装指定版本的软件#conda install 软件名=版本号conda install isoseq3=3.2.1 #查看经安装的软件conda list #卸载经安装的软件conda remove isoseq3 #更新软件版本 c...

问题 磷酸转运蛋白家族(PHT1)在Pfam上关键字搜不到pfam 号,在文章中也没有提到,请问这个家族有隐马尔可夫模型么?

用NCBI搜索PHT1,有一个保守结构域,但是这个保守结构域其他基因家族也有,不是特异的

文章 blast+命令选择

...成6种可能的蛋白质,然后进行36次蛋白质-蛋白质数据库搜索。 需要根据自己需求选择合适的命令。 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分...

文章 从TCGA数据库中下载指定类型样本的数据

...以用TCGAbiolinks 软件包中的GDCquery 函数,指定sample.type 去筛选样本。 比如:需要下载实体瘤组织的样本,那么指定sample.type 为 “Primary solid Tumor”即可: query <- GDCquery(project = "TCGA-LGG", legacy = TRUE, ...

文章 用Ai助手帮我写脚本

当我们想在linux下批量处理数据时,有的脚本不一定能达到我们想要处理的效果,这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说,一些生信脚本是非常晦涩难懂的,google百度得到的回答也时常不连贯,很难顺利...

文章 IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

...胞转录组数据、芯片转录组数据以及eQTL遗传变异数据来筛选类风湿性关节炎中潜在的致病T细胞标志基因。 类风湿关节炎(RA)是一种常见的自身免疫性疾病,全球约有0.5%–1%的人口患有该病。RA的发病机制尚未阐明,仍缺乏有效...

文章 学霸总结:实时荧光定量PCR的结果分析

...知模板进行定量分析的方法。 目前,实时荧光定量 PCR 成为不同样品间进行基因表达水平定量差异比较的权威性方法。在过去十几年中,该方法迅速流行,涉及科学的多个领域,包括农业、环境、工业和医学研究。 实时荧...

文章 双11优惠火热进行中---生信课程历年最大优惠来袭!

...究、生信基础(Linux、Python、R、Perl)等方向,学员数量超过70000人!多门课程被推送到网易云课堂首页推荐位,并在网易官方的金云奖评选中荣获平台潜力奖及严选口碑机构,我们也是唯一入选的生物信息类团队! 全年最大...

文章 天宫一号曾为农业做出的贡献!

...15 分左右,在太空中飞行了六年半的天宫一号目标飞行器再入大气层,再入落区位于南太平洋中部区域,绝大部分器件在再入大气层过程中烧蚀销毁,结束它的历史使命。 作为一名学农的生物汪,每次看天宫一号的新闻,...