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问题 RepeatModeler续跑

请问老师，我的RepeatModeler跑到round-6时因服务器升级停止了，我自己加-recoverDir续跑时提示我的RM_*文件夹包含成功运行的run，但是这个文件夹下没有consensi.fa.classified这个文件，只有consensi.fa，我应该怎么产生这个分类文件用于下...

问题 筛选两个结构域

hmmsearch --domtblout WRKY_hmm_out.txt --cut_tc WRKY.hmm Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa 这是上课讲的hmm筛选出一个结构域，如果想筛选出两个结构域同时存在的应该怎么写脚本

问题 qiime2进行物种注释出错

老师你好，qiime2进行物种注释，出现分类表没有找到特征表的id的情况，问题出在哪里？

问题 请问基因表达模式折线图怎么画

从聚类到画图，应该用什么软件或者R包呢？另外不太明白输入的是表达量还是foldchange？

问题 LD热图绘制问题

在绘制LD block过程中，输入LDBlockShow  -InVCF $vcf -OutPut LD -Region Chr6:1413298-1613298 \     -OutPng -SeleVar 2   然后显示没有snp，然后无法绘图。但是我用vcftools提取该范围的vcf文件，是存在snp的啊

问题 进化树想修改一下分支

用ITOL制作进化树时想让一个颜色的聚在一块，中间正好有一个小枝分割开了，请问怎样才能把他移到旁边呢

问题 做完蛋白组后，验证如何做呢？

挑选几个蛋白进行验证呢？挑选的标准是什么呢？都有什么方法呢？

问题 基因组组装着丝粒问题

请老师帮忙看一下，用调整前还是调整后的基因组注释比较好？

问题 下载了eclipse,但是找不到EPIC

就是下载EPIC的时候没能像您视频里那样下载成功，求解答，谢谢老师。

问题 宏基因组基因定量salmon

老师您好，我在用salmon构建索引之后，对每个样本进行定量时显示不支持RapMap类型的索引，请问该怎么解决？详见图片

问题 R语言中$符号和@符号取值区别？

想得到Vennerable绘制韦恩图，每一个交叉位置对应的ID信息，不知道怎么取得？

问题 Max Quant 打不开.fasta文件

.fasta文件从NCBI和Uniprot上面直接下的都打不开显示配置错误

问题 往测序公司送样品时，需要注意什么？

最近有一批转录组的样品要往测序公司送，样品标注时应该注意什么？

问题 泛基因组 eggNOG得不到结果

做eggNOG的时候，没有结果是咋回事呢？

问题 在做MCScan出现了一下问题，求解

family.ctl PutGLP.txt Put.gffPut.collinearity所有的符号都检查过没有问题，但是不知道为什么会出现JAVA问题