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问题 qPCR问题

老师您好，我想问一下，Qpcr交叉点如何定义？交叉点是阈值吗？有没有固定的定义？

问题 dadi

在你们的课程里面，你们没有讲清楚模型中nu1 =0.0102, nu2 =0.6454 这两个参数有什么用？能不能解答一下。

问题 请问老师，对基因组数据进行处理，保留最长转录本为何会出现一个基因有两个5端UTR？如截图所示。

...？而且就算是这条基因有多个转录本，出现多个utr是正常的，那应该XM也是不一样的，而这个基因XM一致，说明是同一个转录本，但是有两个UTR。

问题 基因家族鉴定

老师好，我问一下：假如原始序列有5个结构域，我鉴定出来的有4个结构域，这个序列还要不要保留？

问题 下载HMM模型

老师您好，请问现在在哪下载hmm。我没找到下载的链接。如图：

文章 基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

...aults handling. Program aborted! 由于是mysql5.7更新导致的，解决方法有三个， 1.取消-v参数： docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \-e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \-d mysql:5.7 这时候 数据库没有备份，不要删除这个mysql容器。在linux服务器...

问题 kasp精细定位

请问kasp精细定位，那个缩小区间的图怎么理解？怎么去缩小区间呢？

问题 docker安装

按照老师给的方法进行安装，docker一直显示正在启动，但是一天了，还在启动...... 其他东西也安装好了

问题 基因组注释 ，seqclean软件报错

...好，在做基因组注释时，PASA_assembly中，seqclean报错，使用的是docker的镜像，已添加export USER='me'   报错信息如下： /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options:  seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec  Standard log file: ...

问题 基因组

老师用你们基因组注释的镜像和脚本进行EGGNOG注释一直提示里面没有tidyverse这个R包，请问应该如何解决。

问题 基因家族鉴定

像这种一条序列有WRKY结构域另外一条序列没有目标结构域的基因要保留吗，还是去除他

问题 circos 这个图

没有线相关是哪个文件夹的问题，反复检查过，Md.blast文件没问题

文章 network.r绘制网络图并输出最大子图节点及网络图

... the width of pic inches [default 12] 参数说明：-e   网络图的边信息文件路径，文件中包含边的起始节点，结尾节点，以及边的权重信息 fromtocombined_scorefromGeneNametoGeneName9606.ENSP000000116539606.ENSP00000046794959CD4LCP29606.ENSP000000612409606.ENSP...

问题 服务器断开

请问任务运行的时候和服务器断开了，会影响任务运行吗？会正常得到结果吗

问题 koeken报错

课程数据资料提供了一个名为koeken1.py的脚本，运行报错koeken1.py 是否还有其他脚本可以使用？