找到约 15 条结果

问题 RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题

...  --case tumor --control  normal -p normal_vs_tumor.edger   Warning: The system is configured to read the RTC time in the local time zone.          This mode cannot be fully supported. It will create various problems          with time zone changes and daylight saving time adjustmen...

问题 蛋白质全长多序列比对

...,第一次粗暴的将WRKY中间一条横杠去掉,结果报错ERROR: The sequences in the input alignment should be aligned in order to us,第二次将结构域中阶所有横杠去掉了没有报错,但是WRKYGQK结构域只显示R且前移了位置,如图,请问如何修改才能将...

文章 ggplot中用字符窜传递变量名称列名等

...column, group=column ) ) } Another option (ggplot2 > 3.0.0) is to use the tidy evaluation pronoun .data to slice the chosen variable/column from the rates.by.groups data frame. library(ggplot2) theme_set(theme_classic(base_size = 14)) # created b...

文章 基因家族分析后续试验怎么做?

...;IF=3.678)题为Genome-Wide Identification and Expression Profiling of the TCP Family Genes in Spike and Grain Development of Wheat (Triticum aestivum L.)的文章,一起来学习下基因家族分析后续实验该怎么做! 背景介绍 TCP基因家族是植物中特有的一类转录因...

文章 Windows Terminal 安装与配置指南

... 可以复制以下内容直接配置文件profiles.json: // To view the default settings, hold "alt" while clicking on the "Settings" button. // For documentation on these settings, see: https://aka.ms/terminal-documentation { "$schema": "https://aka.ms/terminal-profiles-schema", "de...

文章 植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

...种创新团队在国际知名学术刊物《核酸研究(Nucleic Acids Research)》发布了植物微卫星DNA及其标记开发数据库PMDBase。该数据库的创建和共享将为全球作物功能基因组学和分子育种研究提供全面的、便利的基础平台。    微卫星DNA...

文章 PBJ:转录组揭示植物中磷再转运的分子机制

...稻旗叶中磷的再运转问题开展的实验(发在Plant Biotechnology Journal上),利用RNA-seq数据分析相关基因的表达情况及功能的。 材料与方法 材料培育:水稻(温室条件,特定处理的土壤条件,进行生长控制)。 磷含量测定:取开...

文章 IF=5 | 健康犬的肠道微生物组和代谢组对膳食纤维的反应

“ 2024年12月《mSystems》发表了一篇题为“Response of the gut microbiome and metabolome to dietary fiber in healthy dogs”的文章。” 这项研究探讨了膳食纤维与肠道微生物群及其功能之间的相互作用。通过分析健康犬只摄入不同纤维来源和数量...

文章 NCBI 中如何将GI号转换成Accession version

...这里:https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih.gov/2016/12/23/converting-lots-of-gi-numbers-to-accession-version/ 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家...

文章 做基因定位?大家可能忽略了这个最熟悉的技术

...联群体 + 转录组测序 Huang Z, Peng G, Liu X, et al. Fine Mapping of a Clubroot Resistance Gene in Chinese Cabbage Using SNP Markers Identified from Bulked Segregant RNA Sequencing. Frontiers in Plant Science. 2017;8:1448. doi:10.3389/fpls.2017.01448.

文章 R语言“had non-zero exit status”安装报错

...R包时,出现以下报错: In install.packages(...) : installation of package ‘muscle’ had non-zero exit status 导致这个状态的原因有: 1.包加载安装过程中编译不能通过,因此执行安装加载通过不了。 2.library中路径有中文字符出现 3.library...

文章 在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

...d_vs_genome.arf none -d  -g 100000 -l 500  -m 11 -v -P -n d 报错: The debug file is called error.output.mrd_04_09_2023_t_17_09_26 查看 error.output.mrd_04_09_2023_t_17_09_26 报错文件: > The candidate has been discarded because the structure is inconsistent with Dicer processin...

问题 老师你好,构建进化树16S分析一直出错

...ignedDNAFASTAFormat-3r8bwdoj is not a(n) AlignedDNAFASTAFormat file:   The sequence starting on line 2 was length 404. All previous sequences were length 0. All sequences must be the same length for AlignedFASTAFormat. Debug info has been saved to work/my_amplicon/tmp/qiime2-q2cli-err-cojm7_...

问题 docker 如何进入已经退出的容器container: You cannot attach to a stopped container, start it first

docker attach d6c45e8cc5f0 然后我获取了以下信息: 2014/10/01 22:33:34 You cannot attach to a stopped container, start it first

文章 统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

...= element_text(angle=60, vjust=0.5,hjust=0.5)  )+  xlab("")+ylab("Number of DEGs")  #输出图片pdf(file="DEGNum.pdf", height=7, width=7)print(p)dev.off()