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问题 hisat2比对时出现报错

输入命令之后马上就运行完毕,结果出来sam文件是空,summary文件也是错误,请问这是什么情况呢

问题 windows安装Aspera Connect软件

老师,您好,尝试用咱们给网址,进行windows安装Aspera Connect软件,但是点击下载之后出现是乱码,没有正常跳转到安装页面,这个是怎么回事?

问题 windows安装Aspera Connect软件

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文章 sort按科学计数法排序

在使用linux中sort命令排序时,免不了有p值是科学计数法情况 可以使用-g参数来对科学记数法值进行排序,而且默认是从小到大排序。 以下是其他常用参数:

问题 请问什么三个pca成分成pca协变量控制群体结构对GWAS关联准确性影响进行GLM和LLM时,识别到四个协变量,删除第一行截距后,仍旧识别到四个协变量,这是什么啊

 /data/soft/gemma/gemma-0.98.5-linux-static-AMD64 -bfile /wtmp2/user049/yushiyan/prune_/alleledphwemafmissing_LDfiltered.snps -p /wtmp2/user049/yushiyan/phenotype/pheno.txt -c /wtmp2/user049/yushiyan/pca/cpca_no1.txt -lm 1 -n 1 GEMMA 0.98.5 (2021-08-25) by Xiang Zhou, Pjotr Prins and team (C) 2012...

问题 群体遗传课程fasttree建树问题

老师,您好,在用fasttree建树时候提示: 说是有很多不是核酸序列,什么会有那么多K,M,R,S这些呢?打开supergene.phy看了下是这样。 这样会不会影响建树呢??

问题 计算复制基因kaks not equal

老师您好,我想请教一下,什么我用 .phy 文件生成 .axt 文件进行kaks计算时候,依然显示序列长度均等呀

问题 基因家族生信

perl ../script/get_gene_position.pl ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 AT.gff 您好,我运行上述指令时候,出现了下列错误 Can't open perl script "../script/get_gene_position.pl": No such file or directory 请问是什么问题呀

问题 植物线粒体组装后怎么解环

根据线粒体视频中教程组装了自己植物线粒体,视频里植物只有一个单环,而我这个物种比较复杂,请问下一步怎么做,如何解开这些环。

问题 IBD 计算2

命令是后台运行,cp /work/ibd_demo/02.pop_ibd/pop_ribd.sh ./ nohup sh pop_ribd.sh > pop_ribd.sh.o &  这个 pop_ribd.sh.o 运行完什么都没有,什么记录都没有。截图是计算时用文件。

文章 biolinux 挂载虚拟目录注意事项

首先建立本地电脑目录(E:\share1) 英文名字,然后给本地目录起一个代号share(share1自行起名对应箭头需要修改),再用mount命令挂载到linux指定目录(/home/manager/share),也可以自己在linux上新建目录。

问题 提取CDS和蛋白序列出错

图1:我基因组fasta序列;图2:longest_isoform.gff3文件;图三:运行报错;出来CDS文件是空。我是用omicsclass/gene-family:v1.0。请问老师,这是情况该怎么解决呢?

问题 两个基因组间共线性

老师您好,请问两个植物基因组间没有共线性正常吗,我做小立碗藓和卷柏之间,生成二者collinearity文件时候没出来东西,只有表头。谢谢老师!

问题 LTR_retriever结果问题

老师您好,请问课程重复序列注释中,对于LTR_retriever结果文件,哪一个统计了 solo-LTR 结果,.nmtf.pass.list 这个文件里面是不是都是solo LTR?

问题 summarize_taxa.py缺少脚本

自己工作站,运行时,summarize_taxa.py缺少脚本,之前百度网盘下载下来没有这个脚本