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问题 WGCNA样本聚类报错

样本聚类报错如下,上面是我表达矩阵和性状矩阵

问题 在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误,

输入命令是for i in `tail -n+2 $datafile/metadata.txt|cut -f1`;do bowtie2 --threads 6 \ -x $host_index/Canis_lupus/wolf \ -1 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_1.fastq \ -2 $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}_2.fastq \ -S $workdir/1.host_del_and_qc/cleandata/${i}.bowtie.sam \ --v...

问题 GEO双通道芯片数据

您好 双通芯片,应该怎么寻找差异基因。如果想单独看癌或者癌旁表达量,是需要访问原始数据吗?

问题 annovar报错问题

您好,请问您annovar报错问题: Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677如何解决呢?

文章 如何设置服务器RAID

R430 进入RAID设置界面需要开机时按 Ctrl + R 进入。 删除之前配置。 重新设置新RAID,选上所有硬盘即可。

问题 annovar报错问题

您好,请问您annovar报错问题: Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677 如何解决呢?

问题 work.sh.o

我在联系重测序数据时候,解压玩数据出现了work.sh.o, 而且data 没有权限进去。1.jpg

文章 merge_tsv_files.r 根据共有ID横向合并表格文件

...rectory [default cwd] 使用说明: -i 指定多个表格文件所在路径 --by 两个表格共有ID所在列列名指定: --type  合并类型,left 以最左边表格关键列ID准,不存在ID会去除;inner取交集 使用举例: Rscript $scriptdir/merge_tsv_fil...

问题 TSS转录起始位点确定。

请问除了在数据库里找到注释方式外,还有其他方式能够找到TSS位点或什么实验能验证TSS位点不?

问题 提取不出来结构域序列

第一次hmm搜索时可以搜索出序列,但是接下来一步提取结构域序列时出来文件是空

问题 Gc view 作图软件

老师,我想请教一下您关于gcviewer作图软件问题,什么下载完作图软件后,用Java打不开呢?先谢过老师。

问题 做蛋白互作网络时报错

请问图中报错后,我应该怎么解决呢?

问题 下载srr文件

https://www.omicsclass.com/article/1703      用链接方法下载srr, “data assess下面数据可以直接复制链接到迅雷下载”,但是那个链接用迅雷和edge浏览器根本打不开,是什么原因呢?

问题 基因家族鉴定数据准备

老师您好,通过查阅文献可知要用Draper这个做参考基因组做基因家族鉴定,这个那个基因组数据和我们课程上讲示例不一样,可以用这个做吗

问题 最新qiime2教程16S注释报错

我在运行到###alpha和beta多样性分析时候 qiime diversity core-metrics-phylogenetic \   --i-phylogeny $workdir/3.asv_taxonomy/rooted-tree.qza \   --i-table $workdir/3.asv_taxonomy/feature-table-final.qza \   --p-sampling-depth 16900 \   --m-metadata-file $fastmap \   --output...