问题 串联重复基因

...因，我找到了6对，然后绘制了circos图如下，但是发现我的这些结果应该都不是串联重复的呀，是我筛选错了么？这6对基因中的每一对相似性都在95%以上并且都是相同基因，这应该是同源基因把。

问题 MCScanX 圈图都是灰色

老师，你好。我做出来的圈图只有灰色部分，没有红色线条，请问哪里出问题了？以下是我的各个文件截图

问题 文件夹权限受限，无法删除

莫名的scripts和shells文件夹的所有者就变了，既不能删除也不能修改？请问应该怎么办？

问题 TBtools启动子序列提取问题

老师您好，我在使用TBtools提取CDS上游2000kb的序列时，有一个基因的序列如下是怎么回事啊？求指教！谢谢老师

问题 比较基因组数据分类

老师我想知道我做比较基因组的韦恩图数据在哪个文件里，我想知道我做的物种里特有的基因家族但是我不知道在哪个文件里

问题 sudo perl detect_collinearity_within_gene_families.pl -i /home/manager/share/mcscan/MADS_box_family.txt -d /home/manager/share/mcscan/mcscan/AT.collinea这个命令运行后导出的文件是空的，而且我的图好像没有红色线

问题 利用perl script/get_gene_weizhi.pl -in1 new_like_pep.id.txt -in2 westar.v0.gff3 -out DA1_weizhi.txt 提取位置信息后得到的txt里面没有东西，请问是为什么呀

问题 mapchart出现基因染色体错位

做mapchart染色体定位的时候出现以下现象， 配置文件也没有问题，末尾的空白页删了：

问题 command not found

将组学大讲堂的镜像压缩包转成SIF，运行后报错;在组学大讲堂的rnaseq v2.0中运用，同样找不到bwa，请问老师卧室哪里出错了吗？

问题 请教老师mcscanX作图问题

为啥拿基因组里的一个染色体比对该基因组里所有的染色体，一号染色体应该和一号颜色体共线性最多，但是为啥没显示呢

问题 比较基因组学分歧时间脚本

老师好，我在运行比较基因组学分歧时间10和11.的脚本的时候，遇到如下报错，请问该怎么解决？

问题 提取CDS序列失败！！!

图1：我的基因组fasta序列；图2：longest_isoform.gff3文件；图三：运行报错；出来的CDS文件是空的。我是用的omicsclass/gene-family:v2.0。请问老师，这是情况该怎么解决呢?

问题 转录组测序数据量如何选择？

我想做个转录组实验，但是不知道应该测多少合适，公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思？怎么衡量测的数据量够不够呢？

问题 conet构建网络图

您好，我想问一下，在用cytoscape的conet绘制otu网络图，目的是为了探究抗性基因与微生物群落co-occurrence关系，至少要几个微生物样本结果才是可信的呢？只有5个样本可以作出来吗？

问题 基因家族成员命名

老师们好，想请问一下，关于基因家族成员命名的问题！麻烦老师指导一下，谢谢！ 例如，很多基因家族成员都直接命名为WRKY1,WRKY2,WRKY3等。 但如果这些基因已经有其他研究者研究过并对其命名的话，在文章中，我应该如何命...