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问题 kaks计算

你好,我想问问计算kaks时,我利用别人文章数据进行验证,数据从NCBI下载,在TBtools进行提取基因,用MEGA比对和DNAsp计算kaks,可是结果和文章结果不一致。终止密码子去掉也不对,

文章 Linux常用命令(目录、文件、权限)——适合新手小白

 关于目录常用命令: 新建目录:mkdir  (Make Directory) 删除目录:rmdir  只能删除空目录(Remove Directory) ;rm -r (Remove) 查看目录:less 切换目录:cd   (Change Directory) 创建软连接:ln -s 复制目录:cp - r (copy) 当前目录:./ ...

问题 GWAS表型如何表示

请教,做GWAS关联颜色性状,应该怎么表示这个颜色才好,其他性状都是量化具体数值,颜色这个不知道该怎么表示才好

问题 基因家族成员鉴定

由于我基因家族成员过多,建树一直报错,就想尝试结构域建树,就想问问老师如何批量获取我序列结构域,我看ncibiCD search结果中没有提到结构域序列。

问题 并行运行

我现在用是你们独享服务器,显示是双路CPU,那是不是只能运行两路?如果是后台运行话 是不是这样写 ParaFly -c nohup sh w.sh -CPU 2 > w.sh.o& 

问题 老师好,我在做群里遗传进化算pca时,得到文件都是0。但是没有报错

这是输入vcf文件,200万个SNP nohup文件信息:PLINK v1.90b4.6 64-bit (15 Aug 2017)           www.cog-genomics.org/plink/1.9/ (C) 2005-2017 Shaun Purcell, Christopher Chang   GNU General Public License v3 Logging to plink_pca.log. Options in effect:   --allow-extra-chr  ...

文章 CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'

使用conda时报上面错,一般是因路径错误 使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到路径替换下面命令中路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运行之后conda使用就正常了

问题 进化树序列名称如何更改

请问我现在做进化树序列名称“ 29767.m000208” 是什么意思呢?如果想改成下图名称应该怎么操作?

文章 筛选编码蛋白CDS序列

#!python# coding:utf-8'''##############################################################################################北京组学生物科技有限公司#author huangls#date 2021.01.26#version 1.2#学习python课程推荐:#python 入门到精通(生物信息):#https://bdtcd.xetslk.com/s/2bdd89##...

文章 R语言跑循环,如何跳过报错信息?

当使用循环跑R函数时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息,比如这样: 那怎么能让错误信息被忽略掉,接着执行下一次循环指令呢,可以使用try()函数: for () {   err ...

问题 转录组取样应该注意些什么?

最近想做个转录组实验,植物根系,取样时候需要注意什么呢?

问题 转录组数据怎么看测序深度?

我做物种基因有1G,测了6G转录组,测序深度是不是就是6乘呢?

问题 WGCNA 离群样本

构建WGCNA这个里面算是有离群样本吗?各位老师。样本cutheight到底指是哪里?是看类聚最上面那条横线,还是看样品名字所在高度。如果我这里以0.2做阈门,有离群样本吗?

问题 Python如何处理Excel

Python编写脚本,使一个Excel表格内容按照另一个表格批次号排序。

问题 pocketmatch进行蛋白质靶点相似性比较

使用fpocket计算出来蛋白质靶点不能使用pocketmatch比较,它报这个错误Step0-cabbage-core: malloc.c:2401: sysmalloc: Assertion `(old_top == initial_top (av) && old_size == 0) || ((unsigned long) (old_size) >= MINSIZE && prev_inuse (old_top) && ((unsig...