你好,我想问问计算kaks时,我利用别人文章的数据进行验证,数据从NCBI下载,在TBtools进行提取基因,用MEGA比对和DNAsp计算kaks,可是结果和文章的结果不一致。终止密码子去掉也不对,
关于目录常用的命令: 新建目录:mkdir (Make Directory) 删除目录:rmdir 只能删除空目录(Remove Directory) ;rm -r (Remove) 查看目录:less 切换目录:cd (Change Directory) 创建软连接:ln -s 复制目录:cp - r (copy) 当前目录:./ ...
请教,做GWAS关联颜色性状,应该怎么表示这个颜色才好,其他的性状都是量化具体的数值,颜色这个不知道该怎么表示才好
由于我基因家族成员过多,建树一直报错,就想尝试结构域建树,就想问问老师如何批量获取我序列的结构域,我看ncibi的CD search结果中没有提到结构域序列。
我现在用的是你们的独享服务器,显示是双路CPU,那是不是只能运行两路?如果是后台运行的话 是不是这样写 ParaFly -c nohup sh w.sh -CPU 2 > w.sh.o&
这是输入的vcf文件,200万个SNP nohup文件信息:PLINK v1.90b4.6 64-bit (15 Aug 2017) www.cog-genomics.org/plink/1.9/ (C) 2005-2017 Shaun Purcell, Christopher Chang GNU General Public License v3 Logging to plink_pca.log. Options in effect: --allow-extra-chr ...
使用conda时报上面的错,一般是因为路径错误 使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到的路径替换下面命令中的路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运行之后conda的使用就正常了
请问我现在做的进化树序列名称“ 29767.m000208” 是什么意思呢?如果想改成下图的名称应该怎么操作?
#!python# coding:utf-8'''##############################################################################################北京组学生物科技有限公司#author huangls#date 2021.01.26#version 1.2#学习python课程推荐:#python 入门到精通(生物信息):#https://bdtcd.xetslk.com/s/2bdd89##...
当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息,比如这样: 那怎么能让错误信息被忽略掉,接着执行下一次循环指令呢,可以使用try()函数: for () { err ...
最近想做个转录组实验,植物根系的,取样的时候需要注意什么呢?
我做的物种基因有1G,测了6G的转录组,测序深度是不是就是6乘呢?
构建WGCNA这个里面算是有离群样本吗?各位老师。样本的cutheight到底指的是哪里?是看类聚的最上面那条横线,还是看样品名字所在的高度。如果我这里以0.2做阈门,有离群样本吗?
用Python编写脚本,使一个Excel表格的内容按照另一个表格的批次号排序。
使用fpocket计算出来的蛋白质靶点不能使用pocketmatch比较,它报这个错误Step0-cabbage-core: malloc.c:2401: sysmalloc: Assertion `(old_top == initial_top (av) && old_size == 0) || ((unsigned long) (old_size) >= MINSIZE && prev_inuse (old_top) && ((unsig...