问题 IBD 计算2

计算IBD 用这个脚本计算的时候出现这样的错误

问题 老师，我在基因家族鉴定时，用新生成的hmm文件做hmmsearch时，报TC bit thresholds unavailable on model domain的错误。最开始以为是e值太高1e-5,但我后面改为1e-10还是报这个错误。请问老师是什么原因呢？

问题 xpclr绘图

我问下如果我想在xpclr 图上标注基因的名字，怎么用R 你们提供的脚本实现?

文章 从tar压缩文件夹中仅提取某一个目标文件

...夹中仅提取某个目标文件，如果对整个压缩文件进行解压的话，未免太占用空间和资源，我们可以使用如下命令进行操作： 如果我们对压缩文件夹的目录构成不清楚的话，可以使用tar tvf指令进行查看： tar tvf file.tar 比如我...

问题 DoubletFinder报错

老师，可以帮忙看看是什么问题吗，每次都跑不出03. seurat_cluster里边的doubletFinder的部分

问题 有log2FoldChange的值怎么画热图

这个是Leaf-vs-Fruit的数据，这个log2FoldChange是不是Leaf-vs-Fruit的值？有这个值能不能画这个植物某个部位比如说叶的热图，那这个log2FoldChange和FPKM又有什么关系，还是说画某个部位比如说叶的热图要用FPKM，那FPKM这个数据又怎样得来...

问题 怎么下载公共镜像？

我照网上的教程来，搜索不到这个公共镜像，怎么办，Docker里面的

问题 修改样本名称

我用bcftools 修改样本名称的时候，出现下面的错误，我质控后怎么显示这个文件不是 gzip-compressed 的文件那？

问题 PAML使用

老师好，我想计算一下旁系的片段重复基因对间的分化时间，请问有什么教程么？？我们课程里有么？？求推荐

问题 请问我跑一个perl脚本，怎么限定它在服务器的线程呢？因为没有限定线程服务器好响啊，之前有些脚本会提前用-T指定线程，可是这个脚本是我自己写的，突然不知道怎么限定线程了，谷歌没找到答案，求救于此

问题 不好啥意思打扰了，我在服务器上用ClustalW对2000个基因进行比对，想看一下基因多态性，但是比对了很久，显示第5次跑数据了，是出了什么问题吗？比对完成后如何把非此基因的冗余序列去除，并进行可视化呢

问题 circos

下面的这种图用circos怎么画了？文章中写的是用circos软件做的，那咱们课堂中做的圈图的脚本怎么修改就可以做这样的图了，谢谢！

问题 gatk变异检测

请问各位老师，在运行gatk变异检测的时候由于样本过多，怎么进行分染色体的操作呢？

文章 subset_column.r 根据ID列表，取对应列的数据：

...tput file name prefix [default demo] 参数说明： -i 输入要处理的表格，第一列会都成行名 TCGA-D7-A74A-01A-11R-A32D-31 TCGA-BR-7704-01A-11R-2055-13 TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31 TCGA-CD-A4MH-01A-11R-A251-31 TSPAN6 19.71229 15.16812 58.95336274 112.4479129 TNM...

问题 wgcna 数据载入问题

请问老师，数据载入的时候出现这样的问题，是为什么？