文章 关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题

有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘，利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中，获得的info文件中之涉及了String_id，利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么或者Gene Symbol是什么，这些并不能直观显...

问题 有个问题想请教一下大家，从数据库中下载的原始数据的gff文件，他们是怎么得到这些基因的注释信息的的，测完序后根据序列比对吗？

文章 蛋白质定量—MaxQuant软件的使用

简介 MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一，目前认可度相对较高，可针对多种质谱数据。拥有自己的肽段搜索引擎- Andromeda。对于碰撞诱导离解(CID)、高能碰撞离解(HCD)和电子转移离解(ETD)所产生的串联...

问题 老师您好，想请教一个临床数据下载解释问题

...一个问题。以"TCGA-STAD",为例子，按照您的方法下载的临床数据（XML）中，在radiation或drug表格中的患者，是指没有接受过radiation/drug ,还是说没有相关数据，不知道他们是否有接受radiation/drug呢？请问是否官网有相关介绍？谢谢您...

问题 转录组测序数据量如何选择？

我想做个转录组实验，但是不知道应该测多少合适，公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思？怎么衡量测的数据量够不够呢？

问题 利用正则表达式是否可以将一列数据变成三列

类似上述数据想变成 0 \tab3,x x x x\tab3,,,,, 也就是说每三个数据做成一行,

问题 二代测序数据可否用于基因家族分析

样本数据是二代测序得到的，请问二代测序结果可以用来做基因家族的分析嘛？准确性和全面性是否会受到质疑？

文章 6分SCI（医学类）-按这个思路很好发！

...enocarcinoma》。 文章思路 首先看一下文章的分析思路： 数据 551例卵巢癌患者的DNA甲基化数据和临床数据都来自于公开的癌症数据库TCGA。为了构建和检验预后预测模型，将551例数据随机划分为训练数据集（368例）和检验数据集...

问题 人类疾病时序基因数据难找怎么办

在做时序基因（RNA转录组的）预测人类复杂疾病的课题，但是一直找不到合适的数据

问题 运行自己的数据绘制Upset图，这个报错是什么原因呢？

运行自己的数据绘制Upset图，这个报错是什么原因呢？数据也是按照要求整的

问题 不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，分别分析然后编程整理是不是比较好一点，还是舍弃差距过大的数据呢？

文章 用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

这是下载的数据： 这是我想要的结果：以样本名命名文件夹(3521-SR-2) 链接三个文件： 3219-SR-1  barcodes.tsv.gz    features.tsv.gz    matrix.mtx.gz 这里的步骤关键是如何批量提取文件中的样本名字，以下是我的提示语 让ai给我生成...

文章 Adobe illustrator将矢量图转换成位图

...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

问题 怎么给外地的公司发原始数据呢？

我手里有十来个转录组样品的原始数据，想寄到公司重新分析下，但是太大了，应该怎么给他们呢？

问题 请问怎么将数据转化中心化处理，分布在-3到3范围内？

 做热图时颜色变化不明显，想把数据重据转化成下第二个图的样子。(两幅图是同一份数据）