老师好，我在运行PASA_assembly时，因为做的是真菌，best_candidate.gff3有6514个基因，有编码潜力的只有588个，最后筛选的high_quality_gene.gff3只有1538，过滤掉距离太短的只剩下994。您说2500个基因左右即可，但是我预测出来的基因远低于...
想修改WRKY_hmmerOut_final.txt中结构域的18、19列也就是结构域起始、终止位置，不知道具体在哪一列，还有上一次默认做出来的图中发现后面普遍锌指结构不全，应该是要整体后移以下，如图：，结构域缺失较多的基因，CDD数据库中...
...网址：https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2：双击下载的安装包.exe，即可安装打开。 01-3：在登录页面选择“共享连接登录”，输入 共享连接 ，即可登录下载。 01-4：使用共享链接登录 TOS Browser 后，只拥有对应文件或文件...
在进行韦恩图绘制的时候出现报错： 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list，要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B","C") 这样之后再进行绘制就没有问题了 附：...
这是我用的命令 cd $dir/sfs awk '{ print $2}' $data/africa.group.txt | sort | uniq -c # 无外群，生成foldfs easySFS.py -i$data/Africadadi.vcf.gz -p $data/africa.group.txt -a --proj=74,56,60 -o./ ## 生成了3个群体的、以及三个群体两两之间的sfs文件 cd dadi/ mkdi...
老师，按照您给的指令（for i in `find ../01.jcvi -name "pangene_filter.*.last"`;do name=`basename ${i} | cut -d "." -f2`; grep -v "^#" ${i} > ${name}.last; python3 $script/find_1vs1_v2.py ${name}.last ${name}.txt && /bin/rm ${name}.last; Done cat *....
Exception in thread "main" java.awt.AWTError: Can't connect to X11 window server using 'localhost:12.0' as the value of the DISPLAY variable.
老师您好！ 我是课程购买者，但是这三个脚本实在没找到下载地址，请问哪有？谢谢！
...arning提示，gff和fasta都是非模式物种ncbi数据库染色体水平的组装，ga_protein_coding.gff3文件正常生成了，请问warning对结果有影响吗，应该如何解决？谢谢！ agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $gff --attribute gene_biotype --value protein_...
试了一天了，就是不合适
步骤如下： install.packages('hchinamap') download.file('https://mdniceczx.oss-cn-beijing.aliyuncs.com/chinadf.rda', file.path(dir, 'chinadf.rda')) load(file.path(dir, 'chinadf.rda'), verbose = TRUE)chinadf