根据课程指导进行了docker的安装,前面的设置都很顺利,但是安装一直失败,我的是win11的系统,请问有相关教程吗?
...!' -o $species.protein_coding.gff3 请问老师为什么运行这个命令的时候保留的gff文件里是biotype=rRNA/tRNA这些非编码基因(第一个图),而discard的却是protein_coding(第二个图)
qiime2导入数据
采用你们课程的:Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后,Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆,请问如何修复(就是修改可视化Manhattan图的纵坐标)
我的地址是/Users/qianxinhui/Desktop/基因检查,这是我打开的步骤,无法打开,下面是老师的步骤
请问您的问题(TC bit thresholds unavailable on model )后面是如何解决的呢?我也遇到同样的问题,望能指点一二,万分感谢!
我是做植物的,用JASPAR网站预测了转录因子的结合序列,现在想批量预测其调控的靶基因
...some blocks not continuous): 此时并不知道报错内容中所指的“染色体区段不连续”是什么问题 查看vcf文件前几行: 发现VCF文件似乎排序有问题,于是提取了前几行建索引: zcat filter2.vcf.gz|head -n 100 >filter6.vcf.gz bcftools index ...
gff文件中染色体编号从chr00到chr12,但物种的染色体只有12条,在做基因家族染色体定位的时候在chr00上也有基因定位,出来的结果就有13条染色体,请问是怎么回事?
您好,之前参加过贵公司组织的基因家族培训班,其中用的虚拟机,现在需要安装软件,发现python版本低,有什么办法升级? 期待您的回复,谢谢!
老师您好,我的基因组有一条序列比较短,三千多bp,在进行GeMoMa 同源比对预测基因时,这条序列没有预测到,final_annotation.gff 和 gemoma.evm.format.gff3中都没有这条序列的注释信息,在运行 PASA更新时就会导致找不到这个基因序列...