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问题 docker安装失败 win11系统怎么装docker

根据课程指导进行了docker安装,前面设置都很顺利,但是安装一直失败,我是win11系统,请问有相关教程吗?

问题 保留蛋白编码gff

...!' -o $species.protein_coding.gff3 请问老师什么运行这个命令时候保留gff文件里是biotype=rRNA/tRNA这些非编码基因(第一个图),而discard却是protein_coding(第二个图)

问题 Path 'manifest.txt' does not exist.是合并后数据,export share_nas1=/work/data manifest=$workdir/manifest.ckd.txt 这样设置有问题吗?

qiime2导入数据

问题 GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题

采用你们课程:Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后,Manhattan图最高SNP仅仅显示半圆,请问如何修复(就是修改可视化Manhattan图纵坐标)

问题 Mac更换成自己地址后仍然无法打开Docker镜像

地址是/Users/qianxinhui/Desktop/基因检查,这是我打开步骤,无法打开,下面是老师步骤

问题 Plot_MultiPop.pl -inList ld_stat.list -output ld_stat.multi 请问这一步要怎么设置,可以提高图片分辨率呢? 有点不清晰

问题 TC bit thresholds unavailable on model

请问您问题(TC bit thresholds unavailable on model )后面是如何解决呢?我也遇到同样问题,望能指点一二,万分感谢!

问题 如何在全基因组批量预测转录因子靶基因

我是做植物,用JASPAR网站预测了转录因子结合序列,现在想批量预测其调控靶基因

文章 bcftools建索引报错:Chromosome blocks not continuous

...some blocks not continuous): 此时并不知道报错内容中所指“染色体区段不连续”是什么问题 查看vcf文件前几行: 发现VCF文件似乎排序有问题,于是提取了前几行建索引: zcat filter2.vcf.gz|head -n 100 >filter6.vcf.gz bcftools index ...

问题 染色体出现chr00是什么情况

gff文件中染色体编号从chr00到chr12,但物种染色体只有12条,在做基因家族染色体定位时候在chr00上也有基因定位,出来结果就有13条染色体,请问是怎么回事?

问题 请问如何升级虚拟机系统里Python3?

您好,之前参加过贵公司组织基因家族培训班,其中用虚拟机,现在需要安装软件,发现python版本低,有什么办法升级? 期待您回复,谢谢!

问题 基因组GeMoMa 注释问题

老师您好,我基因组有一条序列比较短,三千多bp,在进行GeMoMa 同源比对预测基因时,这条序列没有预测到,final_annotation.gff 和 gemoma.evm.format.gff3中都没有这条序列注释信息,在运行 PASA更新时就会导致找不到这个基因序列...

问题 请问各位老师 我通过trinity拼接出来序列,然后rsem定量,结果出现了比对率很高,个别样本80%多,但是基因表达量都很低,箱型图与密度图都是异常,能解释一下原因么

问题 老师您好,多序列比对完后构建进化树遇到了错误,建不了树,但是删掉几个序列较短基因又能建树,这种情况怎么办,如果在筛出一些基因要怎么筛除

问题 请教一下TCGA蛋白数据怎么理解,它是有正负值,这个正负值代表什么意思,什么蛋白表达会有负值?我只想给它分成高表达,低表达和表达缺失组应该怎么处理呀?