问题 利用geneid_to_mRNAid提取GFF3文件中的信息时候，发现存在很多假基因导致提取失败，想知道这种情况应该如何解决？？

问题 计算串联重复时，满足两个大于75的标准，但是不在一条染色体上，也不属于片段重复（MCscanx结果显示）。请问这种情况属于什么重复方式？

问题 老师您好 我在做转录组找snp用的软件是gatk，在 HaplotypeCaller call 完 没有0/0基因型这是我哪里出了问题吗

问题 老师，你好！在运行meme搜索motif时，等了很长时间，结果文件夹里只有一个txt文件，没有其他的文件，请问这是什么原因呢

问题 老师，我下载omicsclass/biolinux镜像，忘记在docker desktop上修改储存路径，，这个镜像有点大，按照文章推送的方法，好像不行，这个应该怎么去操作呢

问题 老师，我在进行重复基因计算Ka/Ks的时候，一共找到6对串联重复基因，但是其中有3对算不出Ka/Ks，这是为什么？

问题 我想问一下从公司获得测序数据如果是以下的cleandata，我们是否从章节2课时6看起就可以了呢，是否向需要进一步质控？

问题 R语言GAPIT跑GWAS错误 Error in ‘[.data.frame‘(GD,,!is.na(GI.MP[,3])):选择了未定义的列

问题 老师，软连接以后，我的样本名后面加了？这样对吗 在软连接时，我将Rstudio中的gz去掉了，因为我的data数据没有gz

问题 代谢组进行差异代谢物筛选时，必须对t检验的p值进行fdr矫正吗？我看到大多数论文里都是p值哎

问题 wgCNA一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢！

wgcna一个模块中找hub基因 我把cytoScapeinput-edges文件输入cytoscape中 用cytohubba计算 但是每次出来的结果都不一样 试了很多遍也不行 求解答 谢谢！

问题 老师，我用perl script/select_redundant_mRNA.pl去除冗余，结果显示在一行，是不是文件里面的对应名称错了？

这是mRNA2geneID.txt部分截图 这是SBP_domain_new_out_selected.txt部分截图

问题 建树boot是0

老师您看我这个建树的boot值怎么都是0呀？是我哪里做错了吗 还是 mega的参数设置的问题？ 参数设置是：

问题 docker 如何进入已经退出的容器container： You cannot attach to a stopped container, start it first

docker attach d6c45e8cc5f0 然后我获取了以下信息： 2014/10/01 22:33:34 You cannot attach to a stopped container, start it first

问题 做基因组间共线性时用下面这个命令进行过滤，我想问一下这个命令在写文章的时候怎么描述呢？

/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors ATH.rapa.anchors.new