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问题 如何修改perl脚本，利用id号抽提gff文件中的位置信息？

...Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumper; GetOptions (\%opts,"in1=s","in2=s","out=s","h");  if (! defined($opts{in1}) ||! defined($opts{in2})||! defined($opts{out}) || defined($opts{h})){ &USAGE; } open (IN1,"$opts{in1}") || die "open $opts{in1} failed\n"; open (IN2,"$opts{in2}") || die...

问题 在RStudio上用setwd()命令未能修改数据资料路径

...修改数据资料路径，我在D盘建立了新的空的文件夹20251124_data和20251124data，用setwd("D:/20251124_data")和setwd("D:/20251124data")，但是运行不成功，显示： >  setwd("D:/20251124_data") Error in setwd("D:/20251124_data") : cannot change working directory >...

文章 探讨敏捷开发在软件开发中的应用

...方式会更容易取得客户信任，客户能够随时了解到项目的工作状态、工作进度。当相互间具备了信任关系后，余下的工作也会变得轻松、愉快。 在房产项目里，我们在客户现场办公，定期开会讨论需求和设计，当有一些小的不...

文章 dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

...303-0      193     LEFT    135     156     0       YES     22      58.685  45.455  0.0 0.0      3.16    0.0     tctcccttggtactcaacaact  agttgttgagtaccaagggaga  8.849723        4.48    2.64    L1SNP-dCAPS-Hpy166II,68-gtnnac-303-0      193     RIGHT   327  ...

文章 R语言数据筛选整理包dplyr 分类汇总

...)# Warning message: Unknown columns: `vss` # Tips: select没找到额变量，系统会返回警告# 匹配关系：筛选Iris数据集，变量名中带有"wid"的变量名>select(iris, matches(".wid."))>select(iris, contains("wid"))#   Sepal.Width Petal.Width#        3...

文章 GEO数据库之芯片数据下载

...就是进行数据下载，但是进入网站点点来下载，查询搜索工作就不少，下载下来的数据还不一定能看懂。有没有什么方法可以解决这个问题呢？当然有——R包GEOquery！下面就针对芯片数据，教大家用GEOquery包完成下载工作。 GEO...

文章 聚合酶链式反应（PCR）

...分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术。 工作原理    类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火(复性）--延伸三个基本反应步骤构成：①模板DNA的变性：模板 D...

文章 细胞培养中的胎牛血清正确使用指南

...需，在换血清品牌，或者同一品牌换批次时都要做好验证工作，相对来讲批次间差距越小越好，不为品牌，不为价格，只买对的。 学霸姐姐只能帮你到这里啦！ 生物女学霸，一个自称学霸其实很渣的生物汪，努力将有趣的、...

文章 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

...bl.de/ #添加化石校准点时间信息（格式是时间范围’>0.23<0.26’或者时间点‘@0.245’)，单位时百万年前100Ma； #再在首行添加两个数字（物种数量和树的数量），空格隔开，可得到input.tre文件。 # Tip: 可以利用figtree 标记一...

文章 linux系统当中源码安装R，无root权限安装

...可参照这个地方：http://pj.freefaculty.org/blog/?p=3151.安装zlib1.2.5版本及以上cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install2.安装bzipcd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz2_so 修改Makefile 中的PREFIX=/share/work/biosoft/bzip2 make && make...

文章 Rush：一款强大的Linux并行任务执行工具

...理变得更为简洁明了，同时具备灵活性和高效性。 Rush的工作方式是通过提供一个输入列表（例如文件列表，命令列表等）和一个命令模板，然后根据命令模板生成并行运行的命令。它通过内置的调度器，可以根据系统的可用资...

问题 老师，我正在做泛基因家族分析的结构变异与基因注释部分，出现一些错误

...不同的指令，均未能成功修改 sed -i "s/\\.[0-9]*$//" ${ref}_refGene.txt ，之后在excel中完成修改，结果如下：之后，#建立注释库 retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile ${ref}.fa ${ref}_refGene.txt --out ${ref}_refGene.fa   ，在此过程中出现...

问题 误: 无法分配大小为7.4 Mb的矢量 Killed after 9 m

...ple_type <- "Primary solid Tumor"    > legacy <- FALSE > # 工作目录如果不存在，则创建目录 > if( !file.exists(work_dir) ){ +   if( !dir.create(work_dir, showWarnings = FALSE, recursive = TRUE) ){ +     stop(paste("dir.create failed: outdir=",work_dir,sep=""))...

文章 比较好发、版面费又便宜的期刊推荐？

...出版机构已经推出快速网络出版，即文章在被接收后30个工作日左右即可分配DOI号，上线网络版，以便被阅读、下载、引用。大家可以自己去了解一下。4，关于版面费一般国际期刊是不收取版面费的，不同于国内的出版，国外的...

问题 重复序列注释geneID这一步

...==== /usr/lib64/libc.so.6(+0x82b36)[0x73e8f52b2b36] /usr/lib64/libc.so.6(__libc_calloc+0xb4)[0x73e8f52b6214] geneid[0x40b459] geneid[0x40ed29] geneid[0x401aa5] /usr/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5)[0x73e8f5252555] geneid[0x401f8d] 请问药怎么解决？