问题 比较基因组数据分类

老师我想知道我做比较基因组的韦恩图数据在哪个文件里，我想知道我做的物种里特有的基因家族但是我不知道在哪个文件里

问题 没有转录组数据能进行基因家族分析吗？

基因家族分析一般会结合上家族内基因表达数据，假如没有做转录组也是可以进行分析的；1. 假如家族不是太大，可以选择用实时定量进行表达模式变化分析；2. 可以下载其他人上传至NCBI上的数据，只需研究性状及实验设计符...

问题 TCGA数据用您们的脚本下不下来，每个TCGA的project数据组织都不一样，我不知道为什么您们就可以用一个脚本自信的运行所有的project

我的就卡在了图下那个步骤，我那个Project根本没有FKPM数据，您们这个代码的通用性真的令人头大

问题 病毒鉴定需要选数据库吗？

大家好！我想鉴定侵染植物的细菌携带的病毒，鉴定的时候应该怎么选数据库呢？

问题 老师您好我用咱们线下课程的代码做WGCNA，和样品数据相比，我自己的数据在第一步输出的结果都不一样。麻烦老师帮忙解答一下

问题 大佬们，请问在R里如何将横向的数据转换成图中纵向的数据形式啊，这里面的变量名也改变了，拜托解答一下哦o(^o^)o

问题 你好，我这边从GEO数据集中下载下来相应的数据矩阵，发现他的所有Gene Symbol都为空值，想请问一下如何使symbol不为空，感谢大神指教。

问题 请问老师有没有"医学癌症TCGA-基因差异表达分析"课程基因表达数据下载后提取癌症组织数据，并用于课程“医学癌症TCGA-生存分析”的代码，感觉跨度有点大。

文章 植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

...Nucleic Acids Research）》发布了植物微卫星DNA及其标记开发数据库PMDBase。该数据库的创建和共享将为全球作物功能基因组学和分子育种研究提供全面的、便利的基础平台。    微卫星DNA，也称为SSR，是涉及许多重要生物功能的基因...

问题 想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

问题 TCGA下载数据更改了工作目录

各位老师：TCGA下载数据下载了一半，又改了另外一个工作目录，结果出现下面信息，如何解决？谢谢了！

问题 HiC测序下机数据需要过滤吗？

请问HiC数据在分析前需要进行过滤吗？若需要，流程是什么？是否与普通二代测序过滤流程一致？谢谢！

问题 基因家族分析数据准备

基因家族数据准备中，运行到保留蛋白编码基因这一步时运行完检查文件protein_coding.gff3，发现有些基因好像后面不是gene_biotype，这对后面的分析有影响吗？还是需要改一下代码

文章 比较3种差别表达方法对TCGA转录组数据的分析

...ceRNA网络分析》的课程中，我们都介绍了针对TCGA的转录组数据，进行基因的差异表达分析。当时我们介绍的都是采用edgeR 软件包进行的分析， 有学员问我，采用DESeq2 和limma 的方法也可以进行差异表达的分析。当然，这两个软件...

文章 R包venn绘制韦恩图

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...