文章 环境微生物领域杂志影响因子

NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE79.258LANCET53.254JAMA-JOURNAL OF THE AMERICAN MEDICAL ASSOCIATION47.661NATURE41.577SCIENCE41.058NATURE BIOTECHNOLOGY35.724NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY31.851CELL31.398NATURE METHODS26.919BMJ-British Medical Journal23.259CLINICAL MICROBIOLOGY REVIEWS20.642Cell Metaboli...

问题 老师，我在windows10系统下安装docker desktop，但是出现out of memory，怎么办？

问题 老师，你好。orthofinder运行是出现too many values to unpack问题怎么解决

文章 免疫 侵润 分析 ESTIMATE分析

...ez E, et al. Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data. Nat Commun. 2013;4:2612. doi:10.1038/ncomms3612 ## 2.1 加载需要的包 ```{r, warning=FALSE} # 1 安装CRAN来源常用包 #设置镜像，  local({r <- getOption("repos")    r["C...

问题 建立索引

...ePred -genePredExt $gtf unknown_refGene.txt echo "RUN CMD: retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile $fa  unknown_refGene.txt --out unknown_refGeneMrna.fa" retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile $fa --outfile unknown_refGeneMrna.fa unknown_refGene.txt 

问题 MCScan共线性分析画图问题：list index out of range

老师您好 我已经找到了我在chr1A,chr1B,chr1D上同源的一段序列，上面的基因也同源，我相用MCScan画这几个基因的共线性图。但是会报错 我的bed 文件和cds都没什么问题

问题 cafe做基因家族扩张和收缩，报错Failed to initialize any reasonable values

...提示： 不再具体提示差异大的家族ID，但还是报错Failed to initialize any reasonable values，请问各位老师这是什么原因？是因为我选的物种差异太大的原因么？选择的9个物种都是同一个门的物种。请问有什么解决办法么？

问题 hmmsearch出现Error: Failed to open sequence file aa.fasta>uu.out for reading，如何解决呢？？

Error: Failed to open sequence file aa.fasta>uu.out for reading

问题 老师，我在windows10系统下安装了docker desktop，但是一直提示out of memory，怎么办？

问题 请问老师怎么获得这个gff3_file_to_proteins.pl脚本来着？

问题 这条命令报错cat ../id.txt|while read ind;do cut -d" " -f1 ./check/${ind}_pep_need_to_confirm.fa|sed -e "/^>/ s/$/_${ind}/g" -e "s/\*//g" > ./check/${ind}_pep_need_to_confirm.fas

文章 pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

...列。 ccs test.subreads.bam ccs.bam  --noPolish --minPasses 1  2 测序引物和barcode的去除这一步是采用lima 来完成的，这个软件也是官方最新开发出来的程序，速度和准确度都较以往的算法有了很大的提升。还能够基于barcode序列区分不...

文章 压缩或解压软链接文件，gzip或gunzip报错Too many levels of symbolic links

...的文件，想对它进行压缩，但是却报错 gzip: Too many levels of symbolic links 通过看gzip说明文档 可以使用 -c 标准输出到别的文件，报错就解决了 gzip -c raw.filtered.vcf > raw.filtered.vcf.gz 二、gunzip报错 同样的情况，如果对软...

文章 python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 3 values to unpack

多余的空行删除一下，解决问题 edge文件输入错误导致

问题 juicer 报错： Failure during chimera handling of

...2.fastq.gz.sam source line number 298***! Failure during chimera handling of /home/data/t090519/JF/20.Jui/juicer/work/splits/JF2.fastq.gz附件为nohup.out信息，报错在最后几行nohup.out