问题 下载你们的GWAS镜像后，在运行时总卡住，等待一段时间后就报错了，是因为这个镜像没有下载好或者安装正确吗，docker images也可以看到v1.2的版本

问题 老师好，我在跟着课程实操时，运行gatk call snp时候，使用源代码也报错了，我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看，谢谢了！

问题 老师好，我在跟着课程实操时，运行gatk call snp时候，使用源代码也报错了，我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看，谢谢了！

文章 blast 中的e-value值如何理解？

... score值很好理解，即根据不同的打分矩阵，对序列间的匹配程度进行打分，得分矩阵比如PAM和BLOSUM（氨基酸）： e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了，官方的定义是e-value：the number of hits you expect to see by chance/false positive ...

问题 我想利用已上传的转录数据做一个数据分析，现在遇到我查找的ID和上传的转录的ID不一致，我现在该怎么才能查找到我想要的基因的FPKM数据呢？

文章 Rstudio 防止中文乱码（保存与显示）

...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，...

文章 WGCNA分析要求

WGCNA的分析要求，其实在WGCNA官网的FAQ中有介绍。我整理一些大家常问的问题，供大家参考： 1. 需要多少个样本？     1.1 至少需要15个样本，推荐20个以上的样本。     1.2 样本越少，网络的噪音就越大，样本越多，网络就...

问题 基因家族分析,提取一个物种信息后，再次取提取另一物种cds 用基因的ID，作为序列的ID，总是无法运行，显示脚本不存在，但是LL查看脚本是存在的。

Can't open per1 script ''/work/gene_family/scripts//get_gene_longest_fa.p1'':No such file or directory

文章 MEME使用参数说明

...具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据，当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列，这就是蛋白质与DNA相到作用所保护下来的片段。所以使用MEME搜索其中非常相似的序列片段就可能是有一定功能...

问题 基因组共线性图不会分析

各位老师好，本人在公司做了比较基因组分析，但是我以前没有接触过基因组，很多结果看不懂不知道怎么解释，其中基因组共线性图已经有结果了，但是完全不会看，不知道怎么分析，页面上用的软件是mummer，比对方式是nucmer...

问题 bioconductor一直安装不对

.../bioconductor.org/biocLite.R")的时候还是报错，提示我bioconductor版本落后了 > if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) + install.packages("BiocManager") > BiocManager::install("lme4") 'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("re...

问题 老师，您好，我有一个问题不知道怎么解决，想要问您一下 我在学习基因家族分析的课程中，按照课程对WRKY家族分析，最后将WRKY_pep_need_to_confirm.fa文件输入CDD检测时和老师得到的结果不一样，一个domain都没有搜到，用smart搜索结果是和老师做的一样，为什么用CDD搜不到呢？图片中是我搜到的结果，右边框框中都是零，我换了老师做出来的这个文件搜索也是这个结果，这是为什么呢？

问题 您好，我在做生存分析读取文件时，一直提示row.names不能有重复的名字，我把重复的名字以及癌旁组织的样本都剔除了，还是这样一直报错，不知道是什么原因引起 的？

问题 GEO下载到的数据，只有 fpkm，可以用limma包进行差异分析么，试了一下连续两个数据集的所有FDR都是1，用t检验也是一样，不知道哪里出问题了

文章 基因家族分析课程更新2.0

...pubmed上搜索了一下，发的文章还是挺多的： 基因家族分析作为低投入高产出的发文思路，受到广泛关注，分析的人也越来越多，我们也对基因家族分析课程针对之前学员经常遇到的问题进行了更新： 解决基因ID不对应的问题...