问题 Use of uninitialized value $l in numeric lt (

bcftools mpileup -Ou -f 02428.genome.fa I662_sorted_dedup_reads_realigned.bam.recal.bam| bcftools call -c| vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 100 | gzip > 3dilpoid.fq.gz 做PSMC的准备文件vcfutils.pl vcf2fq总是报错Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566. 

文章 基因组中的字符都代表什么

..................Ala.................Alanine(丙氨酸) B.................Asx.................Aspartic acid or Asparagine(天冬氨酸或天冬酰胺) C.................Cys.................Cysteine(半胱氨酸) D.................Asp.................Aspartic Acid(天冬氨酸) E.................G...

问题 ORF (bp) ，domain starteend，Sub-cellular localization和No. of introns怎么找

老师，我想请教一下，根据我们基因家族分析课程的结果，ORF (bp) ，domain starteend，Sub-cellular localization和No. of introns怎么找

问题 WGCNA中性状与模块相关性图总出现colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions错误

之前一切运行正常 Error in colorMatrix[, c] : incorrect number of dimensions 我就不知道哪里出问题了。求助 啊

问题 老师您好，我在使用组学大讲堂docker镜像进行转录组分析时遇到问题

使用get_gene_length_from_gtf.py这个脚本生成gene_length文件时，发生以下错误： raceback (most recent call last):  File "get_gene_length_from_gtf.py", line 50, in <module>    kvs=get_value(tmp[8])  File "get_gene_length_from_gtf.py", line 37, in get_value    k=g.group(...

问题 老师您好，最近在分析基因家族结构的时候遇到了问题。用视频中get_gene_exon_from_gff.pl脚本提取CDS信息时文件为空（参考基因组gff文件只有CDS信息），之后手动提取基因家族序列信息形成gff文件，用TBtools作图也出现了问题，不知道是什么原因？麻烦老师帮我看看呢？

手动提取gff文件长这样 TBtools长这样 ？？？

问题 mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

问题 gff3_file_to_proteins.pl 报错

求助这是哪一步出问题了呢

问题 gff3_file_to_proteins.pl 报错

老师，统一了格式还是会出现，这种情况会是哪里有问题呢

问题 我买了转录组分析的课程，在运行fpkm_and_plot.R脚本时提示Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted， 我打开R语言安装getopt后仍然显示报错，请教各位大神和组学讲堂的老师

文章 corr_network.r—ggraph包绘制展示相关性的网络图

...TH] [-o OUTDIR] [-f PREFIX] Network diagram of correlation：https://www.omicsclass.com/article/1574 optional arguments: -h, --help show this help message and exit -g GENE_DATA, --gene_data GENE_DATA Enter the file path that cont...

问题 您这里的课程筛选串联重复基因的标准是参照这篇文献的extent of gene duplication in the genomes of Drosophila,nematode ,and yeast(2002). Mol Biol Evol。 这篇文献是用的果蝇，线虫，和酵母菌的，可我做的是植物，我还可以用这种方法吗

问题 老师，请问在进行基因结构分析时，运行perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 DOG1_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt . -in2 ../GWHAAAL00000000.gff -out gene_exon_info.gff 代码为什么输出的文件无内容呢

问题 请问docker安装后启动显示out of memory是怎么回事啊…需要怎么办啊…

问题 我运行遗传群体进化的fst_pi_select_sweep.r这个脚本一直报错Error in dev.off() : cannot shut down device 1 (the null device)，将dev.off()语句改为while (!is.null(dev.list()))  dev.off()依旧报错，怎么解决？