您好，我想问一下，在用cytoscape的conet绘制otu网络图，目的是为了探究抗性基因与微生物群落co-occurrence关系，至少要几个微生物样本结果才是可信的呢？只有5个样本可以作出来吗？
老师您好，我看了这个文章，鉴定了9个物种，后面的生理实验只用了葡萄一种，我可以选择其他八个物种中的一个再进行鉴定和后续的实验吗
...的版本信息，第三列通常为gene，mRNA，CDS等信息，同时一个基因可能对应多个mRNA，对生物有些了解的也知道，一个mRNA即是一个转录信息， 这个和注释过后的序列文件也是一一对应的。第四列和第五列分别为基因的第三列信息在...
...趋势 scale()函数 scale(x, center = TRUE, scale = TRUE) x一般是一个矩阵，也可以是一个数值向量 center--是否中心化 scale--是否标准化 1、以数值向量为例： > A [1] 3.74149 7.36180 5.81734 5.71131 7.97054 10.37620 6.29949 5.55062 ...
...果文件中一般都会有GO_enrich.xls的文件，该文件一般在每个差异组合的差异分析结果文件夹下。打开后格式大致如下图所示，各个公司稍有不同，图上红色箭头所指的列应该都有，这几列分别是：Term_type、Description、Corrected_P-value...
老师好！PAV结果中，为什么PAV_gene.list中基因数量（204个）少于02.gene.family/check下gene.pep.fa中序列的数目（218个)？ 如何判断少的这14个属于PAV_gene.list中Fam_N列下的哪个基因？ 或者要重新分析？
单细胞测序，通俗地来说，就是在单个细胞水平上对基因组、转录组、蛋白质组进行测序分析的技术。传统的转录组测序是对多细胞组织进行的混合测序分析，得到的是一群细胞内的基因表达的均值，由于单个细胞之间存在异质...
在网上看见有一个笑话是这样的： 1. 程序员写出自认为没有Bug的代码。 2. 软件测试，发现了20个Bug。 3. 程序员修改了10个Bug，并告诉测试组另外10个不是Bug。 4. 测试组发现其中5个改动根本无法工作，同时又发现了15个...
...称虚设变量、名义变量或哑变量，用以反映质的属性的一个人工变量，是量化了的自变量，通常取值为0或1。引入虚拟变量可使线形回归模型变得更复杂，但对问题描述更简明，一个方程能达到两个方程的作用，而且接近现实。 ...
...示，这里选择了人的早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞的六个样本数据（GSE2600），分析的输入文件是下载的表达矩阵文件，而分析之前需要确保正确安装和加载limma，同时需要对工作路径进行设置。 library('limma')workdir="F:/GEO/201805...
我基于hifi和ont还有hic进行了基因组组装，挂载后通过ont组装的基因组进行了gap填充，gap从11个变为了7个，但是进行polish后直接没有gap了，这个结果可信吗？
老师好，由于时间等某些原因。先把10个样品的gvcf文件合并了生成一个all.vcf后续分析，然后其他几十个样本的gvcf生成之后，是直接和all.vcf可以合并吗？还是说只能和前10的gvcf合并？