TCGA数据下载得到的基因的表达量，其数值是mRNA表达量还是其它的方式计算得到的？
...制相关百分比或者密度频率等类型的图片时可以将对应的数据：小数转换成百分比在坐标轴上显示。借助： https://www.omicsclass.com/article/144 在密度图的基础上将密度坐标小数变成百分比 原图： 修改： library(scales)P_density=P_de...
下载TCGA数据的方式有很多，大致可以分成3类： 1. 采用GDC 工具去下载： 这个其实挺麻烦的，下载后的数据还要合并，不同的数据合并方式还不一样，需要些不少的代码。 2. 从Broad 研究所的Firehose 去下载整理好的数据，但是这...
rank函数是返回原数据由小到大排序后的 ”顺序“ 的下标 举例理解：向量 ori > ori <- c(2,3,1,4,5,6,9,7,8)> rank(ori)[1] 2 3 1 4 5 6 9 7 8 原向量 元素顺序为 2,3,1,4,5,6,9,7,8 由小到大调整 1，2，3，4，5，6，7，8，9 故，...
老师，我从网上下载了一个公布的转录组数据，他每个样品都唯一，没有重复。 这种我在转录组分析的第四步中将转录组数据提取三次，在第五步中分析会报错。 如果在第四步中只提取一次，第五步中也依旧会报错。 请...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
前言 之前我们详细的学习了reshape2包，在数据处理阶段，它帮助我们很容易的实现长宽格式数据之间的转换。而今天所要学习的tidyr包可以看作是reshape2包的进化版本，该包的作者依旧是Rstudio的首席科学家，R语言界的大神Hadley W...
我用了omics docker 里SARtools下载数据，但是发现容器无法联网
老师您好，请问我手里有两类数据，如图，请问是否用后缀带raw的文件像课程中一样从头开始分析。
请问老师 我现在已经分析完基因家族和其花的转录组FPKM，现在需要加荧光定量，这个荧光定量是根据转录组进行的吗？具体要怎么样进行，我文章是聚焦花进行写的，是不是只用采花进行荧光定量分析？
...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA...
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