文章 IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践

TCGA数据挖掘已经烂大街, 单细胞与空间转录组数据分析近年来十分火热,公开的数据也越来越多, 如果结合单细胞数据做生信挖掘分析发文相对新颖且容易得多,接下来我们介绍相应的挖掘文章思路,再利用我们提供的代码可以轻松...

问题 老师，我在两个基因组间的共线性分析时，在excel中用到vlookup时，出现了跟您在课程里实操分析时数据筛选时，只出现了#N/A，不知道是什么原因

文章 GEO数据挖掘生物信息文章解读（拟南芥重金属）

前面我们介绍了GEO数据挖掘的文章（更多见文末链接），大多数都为人类癌症相关的数据挖掘，其实GEO数据库中也有很多动植物相关的数据，也可以用于数据挖掘然后发表SCI论文，这里给大家介绍一篇利用GEO数据库当中的公开数...

问题 各位大佬好！我在筛选一批转录组数据里的差异基因时，当进行到构建dds对象的时候，r语言出现以下报错，说“一些值不是整数”，当我上网查这个错误的时候，有人说是“数据已进行归一化，无法进行DESeq2分析”，请问各位大佬，还有什么解决方法嘛？？谢谢谢谢

文章 TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析

...步骤简述：     1. 从TCGA下载直肠癌的基因，miRNA表达数据     2. 分别针对基因，miRNA进行表达差异分析     3. 分别针对基因和miRNA进行共表达网络(WGCNA)分析，获得聚类模块，并与病理分期这一性状相关联     4. 选择模...

问题 一个基因家族得到两个结构域的ID，然后把两个ID合并去除相同的ID，得到一个新的ID文件保存为fasta形式，传到pfam数据库中，得到一个文件，怎么筛选得到同时具有这两个保守结构域的ID。

问题 老师，在看您教学视频用在线数据库CDD，SMART，PFAM手动确定结构域时，想问问怎筛选目的结构域？保守结构域结果怎么解读，SMART中我批量输入会出错,但是一条一条输入就不会这个要怎么办？

问题 WGCNA相关问题

老师您好，我按照课程中给的代码读取WGCNA基因表达数据，数据格式与示例数据相同，为什么每次dim之后就只有0行和1列呢，后面的筛选也筛选不到基因，聚类树也画不出来，求解答

文章 2019国自然解读：关于CRISPR/Cas9的项目数据怎么样？

...准资助金额共计32.71亿元，单项平均资助金额50.49万元，数据也是非常喜人了。那么，目前生物科学领域非常火热的CRISPR技术收获又如何呢?我们一起来看看。 CRISPR共揽金3485万，最高资助298万! 我们从LetPub统计得知，2019年获得资...

文章 TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析

...因共表达网络分析》的分析方法。 如果您对TCGA数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》《TCGA-基因差异表达分析》《TCGA-转录因子调控》《TCGA-ceRNA调控网络分析》

问题 关于用SVM和LASSO方法筛选标记基因的问题

非 肿瘤的GEO数据，得出差异表达基因后，如何用上述方法进一步缩小标记基因呢，有操作视频么，有偿的也可

问题 关于用SVM和LASSO方法筛选标记基因的问题

非肿瘤的GEO数据得出差异基因后，如何用上述方法进一步缩小标记基因范围呢，有教程或代码么，有偿的也可

问题 关于用SVM和LASSO方法筛选标记基因的问题

非肿瘤的GEO数据得出差异基因后，如何用上述方法进一步缩小标记基因范围呢，有教程或代码么，有偿的也可

文章 WGCNA剔除异常样本

...remove.samples,] datTraits=datTraits[!remove.samples,] 如果您对WGCNA数据挖掘感兴趣，请学习我们的WGCNA相关课程： 《WGCNA加权基因共表达网络分析》

问题 老师您好，我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析，获得了候选基因，我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗？需要怎样判断哪些基因受到正选择，哪些基因受到负选择？谢谢老师！