问题 monocle2是不能用了吗?

官网上已经显示不能用了 但是已经下载好的旧版本是不是也用不了了TAT linux上的r语言也用不了了

文章 blast在linux上的用法

...ectation value)，E值是个统计阈值，缺省值10，意指比对结果中由于随机偶然性产生的匹配结果不大于10,E值越小结果越可靠 -o：查询结果输出文件名 -m：比对结果显示格式选项，缺省值为0，即pairwise格式。另外还可以根据不同...

问题 eclipse中EPCI装好了jdk路径也配置好了 但是perl代码运行不了也不报错这是啥情况啊

eclipse中EPCI装好了jdk路径也配置好了   但是perl代码运行不了也不报错这是啥情况啊

文章 盘点：科研学术圈不为人知的行业“黑话”

...，我就招你”(意思就是，不给工资还要你帮干活。。) Idea：就是idea。。。 表征：就是用仪器检测。学术对话中，“该用什么仪器检测”是一种很naive的话语，应该说“该如何表征”。 工资：在国内泛指本科生的实验室补助，...

问题 老师您好，这两天在ensembl上下大豆整个的注释文件之后，打开发现转录本ID不是基因名而是KRH.....这种的名字，这样的话课上给的那些文本处理脚本很多用不了请问该咋办呀。

文章 ascp 高速下载NCBI各种数据库中的数据（SRA NR NT 分类数据库，）

...在干啥，方便查错。 -T 取消加密，否则有时候数据下载不了 -i 提供私钥文件的地址，免密从SRA和ENA下载，不能少，地址一般是:/share/work/biosoft/aspera/latest/cli/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 设置最大传输速度，一般200m到500m，如果不设置...

问题 老师，最近绘制染色体位置的软件都下载不下来了，MapGene2Chrom web v2也用不了，怎么办呢，老师您这里有MapChart的安装包吗？或者还有别的什么方法吗

问题 水稻中进行MCScanX共线性分析基因家族加倍时，提取不了基因对应的蛋白质序列

...用它利用get_fa_by_id.pl来提取对应的蛋白质序列，发现提取不了，然后发现Oryza_sativa.IRGSP-1.0.pep.all.fa与拟南芥的数据库文件形式不同，没有对应的蛋白质ID，该如何解决？ 拟南芥AT.gff  拟南芥.pep.all.fa 水稻AT.gff 水稻.pep.all.fa ...

问题 老师，我在学习基因家族视频，用perl脚本预测基因顺式作用元件时出现了问题，提取不了位置信息

...我猜想，因为我的基因位置文件缺了一列，所以最后提取不了基因上游的1500序列，可是，老师，我运行get_gene_weizhi.pl后，为什么把GFF里面所有的gene都提取了出来呀，还有第一列的基因ID怎么不见了。 下图是基因组数据的一...

问题 请问是不是真菌ITS无法做进化树文件啊…没有进化树文件可以做a多样性吗？而且用这个命令做ITS真菌a多样性时会提示缺少进化树文件，做不了a多样性

文章 mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

...释，OK，Mercator3.6几秒就变成完成注释，但是页面下载点不了（PS在此以为格式不对，做了各种修改动作），最后发现网页上的注释结果确实下载不了。 Next，:: about Mercator - PlabiPD在注释网站发现一个大坑，The Mapman desktop application...

问题 老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

问题 为什么docker中cocker search 搜不到omicsclass了

找不到做重测序相关的镜像了，用命令下载也下不了

文章 R语言逻辑运算符与算术运算符

...持的关系运算符。 将第一个向量的每个元素与第二向量中的相应元素进行比较。比较结果是一个布尔值。 大于(>) - 检查第一个向量的每个元素是否大于第二个向量中的相应元素。示例代码：v <- c(2,5.5,6,9); t <- c(8,2.5,14,9);...

问题 关于操作中遇到的Perl脚本。

...局限性吧！如果非要完成特定的需求。那么请问如果实现不了的数据提取操作能否用python来写出一个相应的脚本。   因为我最近在入门python，如果可以的话我将会注重这方面的东西。   麻烦老师了，莫笑一个入门学生的幼稚...