问题 老师好，请问在做McscanX分析时，从gff提取的geneID与pep.fa文件的ID不一样，无法提取出蛋白序列，那怎么办？

跟cds文件的id也不一样，cds里的id是mRNA的id

问题 请问我按照TCGA 生存分析教程做的森林图，发现与COX多因素的结果不一致。比如说mic-320b-1，在多因素中p0.05，HR值跨过了1。怎么理解森林图的结果与COX不一致？谢谢

文章 出众的进化树注释软件Evolview

...如何体现分组，这里再推荐另一款同样非常好用的进化树在线绘制软件——Evolview。 Evolview简介 Evolview是一款在线进化树注释软件，能够实现很复杂的注释效果，且用法并不复杂。使用该网站需要注册账号，设置完毕的进化树...

文章 TCGA数据库相关分析工具网站

...能基因组浏览器是集分析、可视化、Galaxy与一体的新一代在线数据分析和可视化平台。现有91个队列的1098个公共数据集包括 TCGA, ICGC, TARGET, GTEx, CCLE等都进行了标准化处理。因此不同的数据集之间可以组合比较。 热图的方式可以...

文章 如何鉴定测序文库是不是链特异性

...到90% 可以认为文库是合格的。 如果您对转录组的数据分析感兴趣，可以学习我的两门课程： 《RNAseq有参转录组数据分析》 《转录组数据挖掘》

问题 你好，我在MCScanX共线性分析过程中用get_gene_position.pl提取基因位置信息的过程中，提取的信息不太对

你好，我在MCScanX共线性分析过程中用get_gene_position.pl提取基因位置信息的过程中，提取到了如下结果，我的物种的基因组gff文件开始部分的格式如图所示，这个要怎么处理呢？谢谢

问题 老师，tbtools更新到最新版本（1.098761），下载安装包以后，安装进度条到一半的时候就关闭了，没有任何提示，这该怎么解决呢

问题 老师你好，blast分析串联重复基因结果文件duplication_gene.out与MCScanX 结果文件 tandem的串联重复基因不一致怎么解释？

问题 GATK分析的第二种方法是不是有问题，怎么运行报错，结果也和第一种不一样，不是特别明白alt列

问题 老师您好，我用plantcare分析顺式作用元件时，只要一上传文件就报错，上传文本（一条序列）的话能正常出结果，不知道这是什么情况

问题 老师您好，我用plantcare分析顺式作用元件时，只要一上传文件就报错，上传文本（一条序列）的话能正常出结果，不知道这是什么情况

文章 如何正确选择差异统计检验

...检验方法给大家总结一下； 微生物多样性测序中的差异分析所针对的“目标”有很多，无论从OTU、alpha多样性指数（如香浓指数）、样本间距离差异（如unifrac）、各水平物种分类（如门纲目科属种）都可以做组间差异分析，从...

问题 QTL-seq数据分析实操课程中命令中用到的qtlplot，如果不使用docker，怎么下载，从哪里获得

下面命令中用到的qtlplot怎么下载，从哪里下载安装到服务器上，不使用docker的情况下 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

文章 论文重复部分如何自动修改？！

...意思是查询内容重复率高达79%，下方是对查重内容的简单分析，如多少单词重复，有几处重复率较高的，哪几处为原创，并且会显示重复内容的来源，点击链接即可查看具体重复内容。 2. Article Rewriter 如果重复率过高，接下来...

文章 NCBI 数据下载

...网站上。今天主要是介绍如何在大型生物数据库NCBI上下载数据。 1. 直接下载：数据量小于5G的时候适用 ① 检索：搜索一个sra号，进入RUN的详情页 ② 下载到本地：选择download一栏会直接下载到本地，不想下载到本地请看③ ...