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文章 Cox与KM生存分析及结果解读

...别,年龄等基本信息。 2. 进行生存分析 这里根据性别这个二分类变量,采用KM算法来估计生存曲线,代码如下(summary结果只显示部分) > library("survival")> library("survminer")> kmfit<-survfit(Surv(time, status) ~ sex, data =  lun...

问题 基因家族鉴定

...不是,但是最后显示的是另外一条不完整结构的WRKYGKK,可以选择另外一条完整的链展示吗,还是因为这条不完整结构的链才是翻译的链所以才在这显示的。

文章 敏捷开发——互联网时代的软件开发方式

...知道已经真正完成了任务?这是一个有趣的问题。在回答这个问题之前,让我们先了解关于敏捷及其方法论。一、在敏捷中如何完成工作简单来说,在项目管理中,敏捷用迭代方法来规划和指导项目过程,这将鼓励变革。这种方...

文章 Uniprot蛋白数据库介绍及使用详解!

...间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章发文新思路,0实验就能发文章,省钱省时间,套路化内容好写易发表,0基础学习最新版基因家族分析/泛基因家族分析...

文章 pubmed按影响因子分类文献

...文献按照影响因子进行分类,如下图所示: 做这个只需简单三步就能完成: 注册NCBI账号 :(如果有账号直接登录)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/进入PubMed 网页 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed制作过滤器,保存并激活 最...

文章 转录组分析结果后还应该干点什么?

...分析结果,之前小编写了一份转录组分析结果阅读指南,可以让大家对分析结果的组成有个基本的认识。 但是看懂了标准分析结果利用数据撰写文章,还差一步,我们还需要对标准分析结果进行个性化分析才能用文章里,...

问题 老师您好,我这边在处理扩增子数据分析时,进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault,用您那边提供的样本数据是有这个报错,请问怎么解决呀!

问题 bootstrap consensus tree的nwk文件不能正常打开

...快就出图了。 我尝试用MEGA7打开nwk文件,Original Tree的可以打开,bootstrap consensus tree的打不开 两个nwk文件大小不一样,Original Tree的9KB,bootstrap consensus tree的4KB。两文件内容格式稍有不同。 请问老师,我怎么才能得正确...

文章 avereps相同ID取均值(limma包函数)

aggregate可以对数据分组处理,见:https://www.omicsclass.com/article/153 页面 limma包提供一个函数avereps可以对相同ID的数据取均值,识别的输入数据可以是matrix,MAList或者EList,后两者涉及芯片数据标准化过程,此处仅介绍如何针对matrix...

问题 您好,我在数据库中搜索了某个物种基因组测序的SRA序列,但没有注释。请问,我可以把它下载下来,就某一个基因家族序列进行注释吗?

文章 外显子测序解析卵巢早衰的遗传因素

...传病因复杂性开辟了一个新的研究途径。 患病家系: 这个近亲家庭来自于沙特阿拉伯利雅得国王哈立德大学医院(KKUH),他们的父母为堂兄妹近亲结婚,总共生育了12个孩子,7女孩,5个男孩,其中家系中有3姐妹(IV-1, IV-6, an...

文章 用cmd来启用软件,这样桌面就简约了

1、第一步先将软件添加路径中 2、第二步,win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了,不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件,如,calc等等。。。。

文章 VIP-转录组数据鉴定病毒

...主要支持两种分析模式: 1. 快速模式鉴定已知的病毒:这个模式是将转录组的测序数据与已知的病毒核酸序列进行比对,找那些reads多,覆盖度高的病毒序列。 2. 精确模式发现新病毒:这个模式是将转录组的序列与病毒的核...

问题 老师您好,我提取了bed文件,但是用perl get_fa_by_id_from_bed.pl Ca.bed Carietinum_492_v1.0.cds.fa Ca.cds这个命令提取的cds文件为0

问题 想请教一下一个问题,用R做WGCNA的Module−trait relationships相关性热图时候,按照官网教程,就出来了这样的图,每个格子太小了,然后我用普通做热图的命令 cellwidth = , cellheight =,不能行。请问这个要怎么调整呢