问题 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

问题 老师，我的电脑是win10家庭版，然后按您给的方法安装docker的时候需要先设置一下Hyper-V，但是我在以管理员身份运行Hyper-v.cmd时，运行过程一直卡在这一步，没有显示百分比，试过好几次了，一直是这样。

问题 老师你好，我想问一下，我做基因家族分析，明明之前建了02.hmmsearch这个文件夹，并且做出来的东西也都放在里面，但是我在终端ll一下，显示total0，然后我新建进化树的文件展示已存在但我在文件夹里并没有找到

问题 Tassel进行自己的GWAS分析中，自动分析pca时，不生成pca1~3文件（使用的是服务器）

执行以下命令，可以显示以上结果，应该是运行过程没有问题。但是实际上并不生成任何文件。 run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h hapmap.ordered.hmp.txt \     -PrincipalComponentsPlugin  -ncomponents 3  -covariance true -endPlugin \     -export pca -runfork1...

问题 基因家族共线性绘图时，画出来的图上只有一对基因连了红线

...萝发表的文章，一些基因对是tandem duplication它也是能够显示在图上，不是Segmental duplication和tandem duplication的基因也都能显示在图上。但是我做的图就只能是这个 分析文件中的一对基因显示在图上。是不是那些文件得怎么合并...

问题 我买了转录组分析的课程，在运行fpkm_and_plot.R脚本时提示Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted， 我打开R语言安装getopt后仍然显示报错，请教各位大神和组学讲堂的老师

问题 Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报错，显示颜色数量不足，怎么解决

文章 boxplot绘图中的离群值Outliers 如何去除

...（Box-plot）又称为盒须图、盒式图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。因形状如箱子而得名。在各种领域也经常被使用，常见于品质管理。它主要用于反映原始数据分布的特征，还可以进行多组数据分布...

文章 投稿时-SCI期刊文章中图片大小如何设置

... 例如我这里有一张图片，来自于Mapman，用photoshop打开，显示尺寸如下： 由于图片尺寸太大，宽度124.99cm ，而且分辨率是72，不符合杂志要求。我这里利用上面学到的知识在不损失图片像素的情况下给大家调整一下图片尺寸...

文章 PBJ：转录组揭示植物中磷再转运的分子机制

...为重点关注对象。 对115个PSR基因进行表达量分析，结果显示磷的转运体编码基因OsPT21，在两个时间点都有非常高的表达量，此外有14个基因在两个时间点都没有表达。 在这些基因中筛选到38 DEGs，26个上调基因包括了OsPHO1、OsPH...

问题 我在WIN2012Servers版安装了一个ubuntu 的Hyper-V虚拟机,现在windows能上网，虚拟机上不了网，用ip addr 查看过，ip与以前显示的不同，怎么回事？打开虚拟机会出现系统出现问题的字样，执行rz命令下面出现一行像是乱码的东西，然后就返回不了了，求高手指点！

文章 必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

...版增加了不同物种同源基因簇的存在或者缺失情况的直观显示及统计信息（绿色表示存在，灰色表示缺失）还可以通过个性化展示功能区进行调整展示内容，以及设置图片颜色、字体等；页面右侧则统计了各物种基因组蛋白数、...

问题 请教一个问题：linux的文件中文件没有末尾结束符用vi打开地段会显示[noeol]，虽然只要把这个文件wq保存后，vim会自动添加末尾结束符。可是现在我有10000个文件，我肯定不能一个一个的打开保存，批量给文件添加末尾换行符也没用，我还怎么办？救急救急

问题 老师您好！用meme分析motif时，输入/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../WRKY_pep_confirmed.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh：no such file ordi

问题 老师您好，我根据您的方法从GFF信息，从基因组里提取基因的蛋白序列和 cds序列，但是显示command not found，请您看看是怎么回事呢？上面写的代码要在分析镜像2.0中进行，但是课程给我们的只有v1.0.1，不知道是不是这个原因呢？