找到约 15 条结果

文章 pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual environment instead: https://pip.pypa.io/warnings/venv 以“root”用户运行pip可能导致权限中断,可以尝...

问题 maxquant蛋白组数据搜库报错

...件,结果报错如下maxquantImpl has stopped working.A problem caused the program to stop working correctly, Windows wil close the program and notify you if a solution is available,不知为何,希望老师可以赐教,先谢过您。 另外想请教下您。maxquant可以用服务器搜库...

文章 技术贴-agriGO简单好用的GO富集网站来一个!

...分析过程。而选定分析之后要确定分析的物种,在2.Select the species中进行物种设定,具体涵盖网站涉及的45个,同时在对应的输入框中输入正确的基因ID。不同的物种对应的ID类型有所差异,具体可接受的ID类型在网页右侧有明确...

问题 一般GEO中的双通道芯片是可以下载到series_matrix.txt文件的,这个文件中我看值应该是去过log2的,我看网站介绍说文件里面的值是Normalized log2 ratio of normalized intensities defined by CH2/CH1,这句话是不是意思是两个样本荧光强度比值取对数之后的数据,如果是的话我可以直接看出基因的差异表达了,我可以直接拿这个数据来作图说明我所研究的基因家族成员发生了差异表达吗?因为在文献中也没有见过这种情况的作图,希望老师指点一下,谢谢老师

问题 用deseq_analysis.r分析差异表达分析时报如下的错误

[1] "abstract_factors is start" Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :   line 2 did not have 3 elements Calls: abstract_factors -> read.table -> scan Execution halted

文章 三代全长转录组鉴定红花黄酮类次代物合成相关相关基因-附原文献下载!

...发表在BMC Genomics上题为:Full-length transcriptome sequences and the identification of putative genes for flavonoid biosynthesis in safflower 的红花三代全长转录组文章。 背景: 红花(拉丁学名:Carthamus tinctorius L.),别名:红蓝花 、刺红花,菊科、...

文章 2020年-基因家族分析文章怎么发!

...l. Genome-wide identification, characterization and expression analysis of the TLP gene family in melon (Cucumis melo L.)[J]. Genomics, 2020. 重点福利来了! 组学大讲堂专注于生物信息培训,已有20000+的线上网课学员和1000+的线下培训学员。是国内第一家开展...

问题 老师,我在用比较基因组学方法做两个物种之间的共线性分析时,是可以筛到某一种基因家族在两个物种中对应的共线性的,但是用下面这种方法做是做不出来某一基因家族在两物种之间的共线性关系的

...soft/MCScanX/MCScanX/MCScanX ST_AT 得到以下结果 Reading BLAST file and pre-processingGenerating BLAST list170 matches imported (1 discarded)44 pairwise comparisons0 alignments generatedPairwise collinear blocks written to ST_AT.collinearity [0.013 seconds elapsed]Writing multiple syntenic bl...

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

... [root@centos7 ~]# vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-enp0s3    TYPE=Ethernet DEFROUTE=yes IPV4_FAILURE_FATAL=no IPV6INIT=yes IPV6_AUTOCONF=yes IPV6_DEFROUTE=yes IPV6_FAILURE_FATAL=no NAME=ens33 #网卡名 UUID=50eff37c-72b4-407a-a3ee-9ef8ca746b95 DEVICE=ens33 BOOTPROTO=static # 等...

文章 百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

...neri Anttila et al. Analysis of shared heritability in common disorders of the brain. Science, 2018; 360 (6395): eaap8757 DOI: 10.1126/science.aap8757

文章 IF=8.86|肝癌免疫相关lncRNA预后标志物文献解读

文章发表在Molecular Therapy Nucleic Acids(IF: 8.86)Immune-Related lncRNA to Construct Novel Signature and Predict the Immune Landscape of Human Hepatocellular Carcinoma 背景介绍 1.尽管肝细胞癌 (HCC) 发生率与死亡率很高,其致病因素繁多,但HCC 的药物治疗也...

问题 ggtern 运行报错

geom_point requires the following missing aesthetics: x and y

问题 老师您好,docker镜像加速后,下载你们的gwas镜像时,总是pull了一半,剩下的立刻就没反应了,尝试了几十次,这个怎么回事?

...dial tcp 104.18.122.25:443: connectex: A connection attempt failed because the connected party did not properly respond after a period of time, or established connection failed because connected host has failed to respond.

文章 TCGA和GEO套路文章解说

...章。 文章1: 文章今年(2018)发表在:Cancer Management and Research 上IF=3.851。该文章发表的杂志影响因子虽然不高,但是分析思路还是可以借鉴的:文章主要分析结论是:利用公共数据(GEO,TCGA数据),通过数据筛选分析后发现...

问题 相关系数矩阵

计算OTU间两两相关系数矩阵 ,数据量大时,可应用WGCNA中corAndPvalue, 但p值需要借助其他函数(the Benjamini and Hochberg false discovery rate (FDR))矫正。具体如何实现呢,望大神赐教!!