找到约 15 条结果

文章 win10 安装最新的基于WSL2的docker

...在转步骤 #2,更新 WSL 2,但如果只想安装 WSL 1,现在可以重新启动计算机,然后继续执行步骤 6 - 安装所选的 Linux 发行版。 若要更新 WSL 2,请等待重新启动计算机,然后继续执行下一步。 步骤 2 - 检查运行 WSL 2 的要求 ...

问题 老师,我想请问一下下面的这个文件里面的数据可以直接用吗?这是下载自对应植物基因组数据库的,就是一些基因在胁迫处理和各个组织器官中的表达量。其次我想问一下有什么方法可以知道这个文件来自那篇文献,这样我觉得有助于理解。

DM_RH_RNA-Seq_FPKM_expression_matrix_for_DM_v4.03_13dec2013_desc.txt.zip

问题 A基因家族的家族成员一共25个,但是23个成员是一个domain,只有是两个domain,这种情况,比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适?不容易得25个成员的全蛋白进化树?

问题 关于集群和anconda的使用,为什么我在集群的管理节点可以跑批量设计InDel标记的程序,但是提交计算节点后就不行了

问题 老师您好!请问我进行samtools染色体长度获取的文件是直接下载的fasta格式文件,怎么处理可以使它每一行序列长度一致呀

文章 群体进化和GWAS文章没那么难发!

...的文章,值得投入不菲的测序费用!有群体资源的老师们可以考虑一下,组学生物愿与您携手共进,再攀科研高峰! 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接...

文章 使用grep函数判断数组元素的有无

...nt "$gene_id\n"; } 使用上述命令,我们可以将数组中等于“$gene_id”的元素不重复的打印出来。 此外,使用grep可以进行一些简单的筛选替换工作,如: grep $_=~s/\s//g,@array; #删除数组内部元素的空格 参考资...

文章 GEO数据库之芯片数据下载

...载下来的数据还不一定能看懂。有没有什么方法可以解决这个问题呢?当然有——R包GEOquery!下面就针对芯片数据,教大家用GEOquery包完成下载工作。 GEO数据 在下载之前要先了解GEO数据库具体存放的四类数据:GSE、GDS、GSM、...

文章 Vennerable绘图组别名称(标签)位置调整

利用Vennerable可以进行绘图,以包自带的数据绘图如下: library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 组别标签位置进行调整  可以基于VennGetSetLabels 和VennSetSetLabels 进行,前者获取当前绘图对象的Set标...

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

...n = "bottom")print(p_bottom) 但是需要主要,legend.position可以用两个元素构成的数值向量来控制,主要是设置图例在图片中间所在具体位置,而不是图片的外围。数值大小一般在0-1之间,超出数值往往导致图例隐藏。 c(0.9,0.7) p...

文章 MENA如何结合OTU共现性网络与环境因子

MENA可以在线分析OTU互作网络(共现性网络) 可参考:https://www.omicsclass.com/article/68 或 微生物OTU网络图绘制(Cytoscape) MENA在完成构建网络(Construct the network)之后,可以对网络进行分析(Analyze the networks),其中一项是结合性状...

文章 采用traceback 进行R语言报错信息的调试

...k 进行初步的判断。 以下是一个示例:在运行gdcCEAnalysis 这个函数时,报错“names' attribute [11055] must be the same length as the vector [2777]” ,你根本不知道是什么原因导致这个错误。采用traceback函数之后,就会显示函数运行时具体...

问题 大家好,我想问一下,做进化树分析,想把一些文件从一个文件夹cp新建的进化树的文件夹,但是cp的时候说找不这些文件,但这些文件就在哪里,不知道这是什么原因呢,直接复制粘贴过去不太行,在终端里ll一下依旧找不

问题 大家好,我想问一下,做进化树分析,想把一些文件从一个文件夹cp新建的进化树的文件夹,但是cp的时候说找不这些文件,但这些文件就在哪里,不知道这是什么原因呢,直接复制粘贴过去不太行,在终端里ll一下依旧找不

文章 几个样品的转录组文章很难发了?这篇文章一定能给您启示

...miltiorrhiza)是中国传统的药用植物,其生物活性成分主要可以分为两类:水溶性的酚酸、二萜类丹参酮。已有研究证明茉莉酸甲酯(MeJA)可以同时提高酚酸和丹参酮的产量,而酵母分泌物(YE)只能诱导丹参酮的积累。作者通过...