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问题 在做WGCNA分析时,基因表达数据文件的基因的ID在最后一列,由于数据量很大,改动可能造成数据混乱,所以想请问一下,代码需要做怎么的改动让他识别左后一行才是名称呢?

问题 老师,您好,我想问一下,公开的RNA-seq数据还有基因组重测序的数据,上传到NCBI的都是原始数据么?如果我对某些感兴趣可以自己学着分析么?有课程么?

文章 手把手教你使用GSEA分析!

...境)就可以进行GSEA分析。 打开分析软件,第一步是载入数据,如下图所示,点击红箭头指向的1出的Load data会出现右边的界面,从箭头2处点击载入要分析的数据,包括表达数据和表型数据,如果数据格式正确就会弹出箭头三处...

文章 gnomAD人类变异数据

...个组织收集和整理了各种大规模的外显子和全基因组测序数据,并面向全世界免费开放。在它的第一个版本中,只包含了外显子测序的数据,称为Exome Aggregation Consortium(ExAc)。 官方网址如下: http://gnomad.broadinstitute.org/about     ...

问题 Rstudio读不出文件中的数据

按照图片中的代码输入文件数据,能够读出dim(FPKM)和names(FPKM)。但是datExpr0命令之后是显示一串空白之后,显示omitted 30 rows(即全部数据都没读出来)。我是把excel表格中的所有数据复制,直接粘贴到新建的txt文件中的,...

问题 转录组数据下载

为什么转录组标准分析后的数据挖掘课程到数据下载就没有了?而且后续也没看到有关课程?

文章 Excel数据分析技巧之方差分析

...次重复,用以检测该处理对水稻产量的影响。具体操作:数据--数据分析--方差分析:单因素方差分析--确定。 1、选中目标数据,点击工具栏中“数据”选项。 相关概念解释:方差分析中,所要检验的对象称为因素(factor)...

问题 老师您好,我的重测序数据在NCBI上按照(双端下载是这样:https://www.omicsclass.com/article/1703)这个教程下载的,但是在做数据质控的时候总是报错,以下是数据,您看看哪儿存在问题。

问题 GEO数据分析

老师,在GEO数据库里头,一个GSE数据对应多个GPL平台,应该怎么选择?

问题 检查数据是否正确

...)allowWGCNAThreads()ALLOW_WGCNA_THREADS=4memory.limit(size = 20000)# 检查数据是否正确:exprSize = checkSets(multiExpr)# 统计样本数量和基因数量 运行结果: > multiExpr=read.csv("5000.csv",header=T,comment.char = "",check.names=F) > datTraits=read.csv("Trait1.csv",row.n...

文章 蛋白质组学数据定量搜库 | MaxQuant软件的使用

简介: MaxQuant是基于质谱(Ms)的蛋白质组学数据分析最常用的平台之一,免费使用,目前认可度相对较高,可针对多种质谱数据格式(.raw、.wiff、.mzML、.mzxml)。且内置了自己的肽段搜索引擎- Andromeda。 MaxQuant支持标记定量和非...

问题 转录组数据概况

 1、三个生物学重复,得出三个数据,是取平均值列表吗?比如这几个数据。 2、是不是一个样品三个重复做一个文库,还是?

问题 转录组数据分析

作为一个小白,怎样零基础开始学习转录组的数据分析,能针对不同的数据合理分析。

文章 组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

...新的2022.8这个版本。另外,我们也对qiime2的物种注释分类数据库进行了同步更新以避免数据库与scikit-learn版本不一致时的报错,因此,老版本的qiime2分类数据库和新版的qiime2分类数据库不通用;同时我们也更新了真菌数据库的版...

问题 怎么从全部的300份重测序数据的vcf.gz文件中抽出自己的想要的200份数据