1.频谱生成 ∂a∂i是一个强大的软件工具，用于模拟多个群体间遗传变异的联合频谱，并将其用于群体遗传推断，而频谱文件可以从VCF文件中获得。 在种群分化之前存在的基因型是祖先基因型（ancestral），而在分化后突变产生...
利用ggplot2绘制分组柱状图，并进行组内分隔。 加载R包、设置数据 library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E")B = c(90,34,56,99,15)C = c(50,20,24,70,14)dat = data.frame(A,B,C)names(dat) = c("type","sample1","sample2")dat = melt(dat,variable.name="Sample",va...
... cluster 之间的对象更为相似。 由于 “cluster” 没有一个明确的定义，因而会有基于不同的模型的聚类算法，其中被广泛运用的聚类算法有以下几类： 基于连通模型（connectivity-based）的聚类算法： 即本文将要讲述的层次聚类...
文章投稿，除了文好当然还要“颜好”！在这个看脸的世界，为了给文章加分，各位老师学生也是做足功课了！但是不会编程敲代码？——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常常见的一种图片...
...。 2、WGCNA分析对样本数量的要求？ 一般来说需要至少15个样品以上，这个是包含了生物学重复的（如5个点，各3个重复）。当然，样品数量越多，结果会越准确。 3、不同批次的测序数据可以放在一起进行WGCNA分析么？ 理论上...
结构域确认用到的序列文件： 导入Interpro后我的结果： 老师的结果: 为什么不一样呢，没有出来结构域信息
使用说明 Rscript $scriptdir/enrichGO_pip.r -husage: /work/my_stad_immu/scripts/enrichGO_pip.r [-h] -g gene.list [-d ann.db] [-t idtype] [-s show.type] ...
GAPIT 作为一款基于 R 语言的 GWAS 软件，在多个领域，尤其是动植物育种行业，收获了众多的用户。FarmCPU 是 GAPIT 工具箱中的最新的模型，具有统计效力高，速度快的特点。BLINK 作为FarmCPU 的 C 语言升级版，对关联位点具有更灵敏...
... 语法cd (选项) (参数)选项-p 如果要切换到的目标目录是一个符号连接，直接切换到符号连接指向的目标目录 -L 如果要切换的目标目录是一个符号的连接，直接切换到字符连接名代表的目录，而非符号连接所指向的目标目录。 - ...
...T检验是用t分布理论来推论差异发生的概率，从而比较两个平均数的差异是否显著。在R语言中T检验用的方法为:t.test(),如果数据不符合正态分布，也就是数据当中有较大的离群值时，可选用非参数秩和检验法，如Wilcoxon test，R语...
...mai.longest_isoform.gff3 -o xiaomai1.bed 共线性分析 1. 分析4个物种之间共线性区域我们主要研究黑麦和其他物种之间的局部（chr1）共线性关系。首先将bed中的1号染色体的相关的区域提取出来。注意：小麦是异源6倍体，有三个亚基...