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问题 SNP数据统计

...该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总数不一致，那SNP总数应该按哪个计算呢？

问题 关于转录组建库的问题。一是一个样品就是一个文库么？样品建库混合后如何能区分每个样品？二是文库如何被索引？

看到一篇文献上说“文库被索引，若干个文库被归一化然后合并起来，在单个流动小室上运行。总共多达100个文库运行在一个16道（lane）的流动小室上，是通常的做法。”

文章 蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

...进行分析，虽然分析的全面，但每次只能分析一个，因此在这里教大家使用可以分析大量蛋白质理化性质的软件——TBtools 具体操作如下： 大家可能会担心两个工具计算的结果是否一致，在这里我可以告诉大家，经过比对结果...

问题 Treemix分析中无法生成input.frq.strat文件

根据正常的流程跑下来，但到第二步的时候发现自己生成的文件只有input.frq，没有生成input.frq.strat文件，这是怎么回事？求老师解答

问题 Treemix分析中无法生成input.frq.strat文件

根据正常的流程跑下来，但到第二步的时候发现自己生成的文件只有input.frq，没有生成input.frq.strat文件，这是怎么回事？求老师解答

问题 lasso cox 进一步筛选预后基因（排除共线性），简化模型

按着步骤下来，这是什么原因呢？是我哪里弄错了吗？ 该怎么解决呢？老师们

问题 请问左边这个图是什么图呀？应该用什么 进行构图？

请问大神们 这个左边的应该怎么画？这个图叫什么图呀？用文章中材料方法里的那种R包话呀？

问题 物种间共线性分析染色体不显示字母

在做物种间共线性分析的时候，画出来的图中染色体不显示字母怎么解决，配置文件如下 图1：bed文件 图2：mcscan_seqid文件 图3：mcscan_layout文件 图4：

问题 gene-family镜像中paircoil2报错

./paircoil2 ../Abrus-precatorius-pro.fasta 1.txt ERROR: Error while reading from <GenFreq> file 请问老师这个怎么解决

问题 用MCScanX分析没有得到tandem文件

...是我运行错误还是就是没有共线性？ 注：已检查gff文件和Blast文件里的基因名，是一致的

问题 tree_tax出错

...14 分箱结果系统发育树，执行以下代码： # 合并树文件和属级别tree_tax = full_join(tree,tax_info,by="label")点击tree_tax，发现其中的data为0×0 而课程视频显示的为：34×4请教，是哪里出问题，该如何解决？

问题 做植物BSA集群关联分析的时候，取样有什么原则？

我手里有一个F2性状分离群体，想问下如果使用BSA方法去做基因定位的时候，每个混池应该取多少样品比较合适？重测序的时候深度怎么选择？

问题 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

修改分支颜色时，就显示如右上角无法保存修改，拖拽数据时，也显示无法识别，用自己的文件和实例文件都是这样，求解答。

问题 顺势作用元件绘图时，图片有问题。基因id排列顺序乱

老师，我在用gsds绘制顺式作用元件时，如下图，有的线条隔行显示。我单独输入基因的bed文件显示正常，请问下这个要怎么调整

问题 基因表达量的相对表达

...一化法，2^-ΔΔCt这种形式的柱状图，这个显著性是实验组和对照组ct值的比较还是怎样比较啊，加Q1373917905有偿，