问题 老师您好，我在hisat2建立索引时报错，向您求助

尝试过两个数据库的fasta文件，都不行，这是怎么回事呢

问题 重测序

重测序分析的是并行任务运行怎么出错？命令是nohup ParaFly -c  work285.sh -CPU 8 > work285.sh-4.o& ， 而不用并行命令 直接运行nohup sh work285.sh >work285-3.sh.o& 这个命令就不报错，这是怎么回事？ sh: -I: command not found warning, cmd:...

问题 基于WSL的docker ， CPU 内存 如何设置？

我是买了扩增子课程。第一张图片是我遇到问题的截图，第二张图片是课程的操作。因此第一张截图的docker容量，接下来我该怎么操作呢。感激感激

问题 GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

文章 常见的OrgDB包，方便对应物种注释

...习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入...

问题 单细胞测序细胞通讯分析

..."hgnc_symbol"需要修改吗？改为什么？是否需要同源映射？怎么操作？谢谢老师。

问题 泛基因筛选最长转录本时出现问题

根据教程运行保留最长转录本的时候，跑了好几个小时，它程序终止了，但是很多跑出来的.longest_isoform.gff3  文件有一部分是有内容，有一部分是空的，现在我要怎么做，可以保留已经跑完的id，然后继续跑没跑完的

文章 tar.gz 文件很大，但是我只想要其中的一个文件，如何指定解压对应的文件

tar.gz 结尾的文件，在linux系统当中为打包之后再压缩的文件，如果想解压这种结尾的文件，可以用如下命令： tar zxvf file.tar.gz 但是，如果压缩文件很大，而自己只想看看这个压缩包里面的某一个文件，要把整个包都解压就...

问题 使用ensembl下载的人gff3文件进行基因家族分析时，保留编码蛋白基因的命令无法识别人的gff3文件（描述中为日志）

[root@7f6d1fb335c2  10:35:58 /work/desaturase/01.data_prepare]# genome=Homo_sapiens.GRCh38.dna.toplevel.fa.gz [root@7f6d1fb335c2  10:36:17 /work/desaturase/01.data_prepare]# gff=Homo_sapiens.GRCh38.112.chr.gff3.gz [root@7f6d1fb335c2  10:36:31 /work/desaturase/01.data_prepare]# species=Homo_sapi...

问题 使用xpclr分析出现TypeError: ufunc 'true_divide' not supported for the input types'

... any supported types according to the casting rule ''safe'' 请问这要怎么解决呢

问题 MCSCANX共线性图代码报错

您好！我也遇到了 Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException at family_circle_plotter.paint(family_circle_plotter.java:197) at family_circle_plotter.main(family_circle_plotter.java:334)  这样的问题，想向您请教一下您当时是怎么解决的呢？

问题 ggplot2安装成功后library("ggplot2")报错

具体情况是这样的，说我字体数据库里没有这样的字体，这种情况怎么解决？

问题 MYSQL做pasa_update的时候报错

老师您好，我用的docker，做基因组注释到pasa_update 的时候报错了，请问怎么解决呢？麻烦老师了

问题 R 语言批量做相关性分析correlation

有很多基因，测了转录组和蛋白质组，需要看看基因之间的相关性，基因太多能批量求每个基因的相关性吗？

问题 芯片探针解读

...个问题关于芯片探针的。就我有一个芯片同时测得是mRNA和lncRNA。然后，根据平台文件的Gene sybmol进行注释，但是有很多Gene sybmol是这样子的XLOC_l2_007835，XLOC_l2_015212这些是什么东西？也不知道它是不是基因，可不可以把它去掉？还...