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问题 了镜像(omicsclass/pop-evol-gwas:latest)

老师您好,我在进行群体遗传进化分析时下了docker中关于omicsclass/pop-evol-gwas:latest镜像,一直显示报错,请老师帮忙解决

文章 mcsan结果文件说明

使用mcscan进行共线性分析会得到很多文件,对我们最有用的是 *.anchors 和  *.anchors.simple。下面分别进行说明。 *.anchors.simple  是共线性结果文件 ,如图: 每一行是一个共线性区块,各字段含义: ref_start_gene参考基因组共线性...

文章 笔记本电脑本地连接以太网时如何手动设置IP?

...的时候,路由器会自动给你分配一个内网IP。这个IP也是固定的。 有时候我们会突然遇到连接断网的情况。在排除硬件坏掉情况下,最大原因是自动分配的IP失效了,这时候我们可以选择手动设置一个IP,尝试解决问题。 点击...

问题 利用gblocks提取序列保守结构域时报错

...酸序列拷贝到gblocks中,都报错,页面如图,烦请您帮我分析下问题所在。多谢老师吝赐教!另还想请问您,gblocks中有两个options选项,这个在选择时有没有什么依据?

文章 轻松下k8s.gcr.io,gcr.io,quay.io镜像

...ker version 20.10.12x86_64二.前言在云计算和云原生的环境下,可避免的会使用很多镜像创建容器,其中有些镜像只有谷歌镜像仓库才有,但是国内可以直接下谷歌仓库的镜像,下面推荐几种方法,k8s.gcr.io,gcr.io 是谷歌的镜像...

文章 TGS-gapcloser 安装与使用

...组装的fa        --output test_ne  \#输出前缀        --ne # 需要进行polish 采用ONT数据补gap: seqkit fq2fa ont.fastq.gz > ont.fastatgsgapcloser  \        --scaff  scaffold-path/scaffold.fasta \        --reads  ont.fasta \ #ont数据转换的fa文件    ...

问题 关于mapman使用过程的问题

进行可视化分析的时候,出现下列英文: 2496 out of 2456 data points have been sucessfully mapped to the bins of the choosen maping. However the pathway you choose does not show any of this bins.Either add those bins manually to this pathway or choose a different Pathway! 数据ID...

文章 Screen:命令行下的多窗口管理器

...有一个 Screen 会话: screen -r 分离 Screen 会话 你可以在终止程序的情况下分离 Screen 会话: 按 Ctrl-A,然后按 D 这样你就可以退出 Screen 会话,而其中运行的程序依然在后台运行。 高级用法 创建多个窗口 在一个 Screen 会话...

问题 如何获取一个基因家族在拟南芥植物中的所有成员!!!

想法是获取拟南芥植物的所有成员序列,然后通过分析获取隐马可夫文件,然后通过该文件在新的物种中获取该物种的一些信息? 以及如何构建隐马可夫模型

问题 ALLHIC1挂出现问题

...II。但是运行的时候,出现报错。报错如下:  Wed Jul 23 15:32:05 2025: PreprocessSAMs.pl: samtools view -bS sample.bwa_aln.sam -o sample.bwa_aln.bam       2 /share/work/biosoft/ALLHiC/ALLHiC/scripts/PreprocessSAMs.pl sample.bwa_aln.sam draft.asm.fasta DPNII       3     ...

问题 求助,如何获取基因与mRNA的对应关系?

老师好,最近在学习您的课程《基因家族分析》,在获取基因与mRNA的对应关系时遇到一个问题。由于根据结构域预测导出的结果中给的是mRNA的Name,而是ID,因此无法参照您给的命令得到想要的结果,但又知如何操作,望指点...

问题 WGCNA可以将来自同组织的表达量数据放在一起计算吗

各位老师: 请问WGCNA可以将来自同组织的表达量数据放在一起计算吗? 我有四个同组织的表达量,每个组织三个重复,可以当作12个样本将表达量进行WGCNA分析

文章 CentOS 7 yum安装报错

...           subscription-manager repos --disable=<repoid>     5. Configure the failing repository to be skipped, if it is unavailable.        Note that yum will try to contact the repo. when it runs most commands,        so will have to try and fail each time (and thus. yum will...

问题 isoseq3使用问题

 您好,我看了您发布的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的文章,另外我在github 上也看了isoseq3的流程,发现您的文章中没有isoseq3 refine 这个步骤。过虽然github上有这个步骤,但是isoseq3 中并没有refine 这个工具(...

问题 群体遗传构建进化树格式转换报错

老师好,请问我在群体遗传分析构建进化树这一步运行转换为phy格式的文件,“run_pipeline.pl  -Xmx180G -importGuess  $workdir/00.filter/clean.vcf.gz  -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter” 得到了如下结果,一直提示能有染色体名...