找到约 15 条结果

文章 python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 3 values to unpack

多余的空行删除一下，解决问题 edge文件输入错误导致

问题 python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 0 values to unpack

文章 安装R包报错 fail to lock directory

...试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录，这通常是因为之前的安装进程没有正确完成，导致锁文件（一个隐藏的文件，用于防止同时写入目录）仍然存在。 解决...

问题 mRNAid_to_geneid.pl这个文件是所有基因共用的，还是不同基因这个文件也不同

问题 less 打开时显示may be a binary file

问题 导入虚拟电脑时出现VBOX_E_FILE_ERROR

问题 docker 如何进入已经退出的容器container： You cannot attach to a stopped container, start it first

docker attach d6c45e8cc5f0 然后我获取了以下信息： 2014/10/01 22:33:34 You cannot attach to a stopped container, start it first

问题 泛基因家族分析cds提取出现killed

...01.cotton_data_prepare]# /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl --gff3  ./${ind}.AD4.longest_isoform.gff3 --fasta ./${ind}AD4_JGI.genome.fa.gz --seqType CDS >./${ind}.cds.fa Killed

问题 基因家族解析报错

...index out of range 2025-06-06 08:34:28 : Done 5000 of 32458 ERROR, input file does not exist: /home/us070/GC/02.gene_family/pep/OrthoFinder/Results_Jun06/WorkingDirectory/Alignments_ids/OG0004708.fa WARNING: Unknown caught unknown exception ERROR, input file does not exist: /home/us070/GC/02.gen...

文章 /share/work/biosoft/R/R-v4.0.3/lib64/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libicuuc.so.50: cannot open shared object file: No such file or directory

 cp /share/work/libicui18n.so.50 /usr/lib64/  cp /share/work/libicudata.so.50 /usr/lib64/ cp /share/work/libicuuc.so.50 /usr/lib64/

问题 请问QQ图绘制时报错，文件明明在，却找不到文件怎么回事啊？

> library(qqman) > results_log = read.table("logistic_results.assoc.logistic", head=TRUE) Error in file(file, "rt") : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, "rt") :   cannot open file 'logistic_results.assoc.logistic': No such file or directory

文章 perl 中glob函数

...返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。 @files = glob "/home/site/*.fasta" 上面的glob的用法相当于如下: opendir(Dir,"/home/site");@Files=readdir(Dir);closedir(Dir);foreach $Cur(@Files){$File="/home/globtest".$Cur;open(IN,$File);while(<IN>){......  ...

文章 用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

...： #!/bin/bash# 遍历当前目录下所有以 GSM 开头的文件for file in GSM*; do # 提取 _ 到最后一个数字的内容 identifier=$(echo "$file" | sed 's/.*_\([^_]*[0-9]\).*/\1/') if [ -n "$identifier" ]; then # 创建对应的文件夹，若文件夹已存在则不报...

问题 在R中进行差异表达分析，运行GDCdownload(query = query, directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')代码时，数据下载失败，并显示如下错误

Error in download.file(url, method = method, ...) :    无法打开URL'https://gdc.cancer.gov/files/public/file/gdc-client_v1.5.0_Windows_x64_0.zip' 此外: Warning message: In if (grepl("^https?://", url)) { : 条件的长度大于一，因此只能用其第一元素，还请各位大神帮帮忙...

问题 omicsclass/pan-genome:v1.1镜像OrthoFinder.py报错

...inference failedlocal variable 'speciesTree' referenced before assignment File "/share/work/biosoft/OrthoFinder/OrthoFinder_v2.5.5/scripts_of/__main__.py", line 1790, in main GetOrthologues(speciesInfoObj, options, prog_caller) File "/share/work/biosoft/OrthoFinder/OrthoFinder_v2.5.5/scripts_of...