文章 Mapchart绘制基因染色体位置图

...的染色体位置图都不方便。在这里，小编给 大家介绍一个比较早的软件Mapchart，来帮助我们解决这一烦恼。 Mapchart是Windows系统下，进行基因在染色体上定位图片绘制的工具，主要是针对遗传连锁图和QTL。区别于遗传图谱中遗传...

文章 Upset图绘制

...data,nsets = 10, #可视化数据集数量nintersects= 60, #显示前多少个交集main.bar.color = '#6778AE', #柱状图颜色matrix.color="black", #集合点的颜色sets.bar.color= "#F3B1A0", #条形图条形的颜色set_size.show = F, #是否在条形图上显示集合大小shade.color = "#53A8...

文章 混池（BSA）定位必看的10个知识点！

...取样、提取、测序等方面有不少疑问，在此我们总结了10个设计BSA时最常见的问题，希望对大家有所帮助。 Q1：取材时对亲本有什么要求？ A1：亲本要选用尽量纯的个体，可通过自交进行纯化，两个亲本要在目标性状上有显著...

文章 数据分析实用技能—Excel函数使用—VLOOKUP：数据批量提取及数据合并

...列中查询的值。 第二参数是需要查询的单元格区域，这个区域中的首列必须要包含查询值，否则公式将返回错误值。如果查询区域中包含多个符合条件的查询值，VLOOKUP函数只能返回第一个查找到的结果。 第三参数用于指定返...

问题 老师，为什么pav分析结果是这样，上面显示我的基因编号到99了是为什么啊，没有这么多基因呀，我做出来一个基因组平均才十几个

图太大了放在评论里了

问题 等位基因的取舍

老师，您好！我的目标物种是一个二倍体植物，在提取蛋白序列后将等位基因一起提取出来，等位基因有着一样的蛋白序列，那我是不是只要分析其中一个基因就可以了啊？ 比如我总共筛到了包括等位基因共90个，那我是不是只...

问题 老师您好，急切请求帮助！MENA分子生态网络分析时，上传200个OTU节点，但是最后显示nodes为383 （其中一部分不包括上传的节点），请问这样的结果合理吗？怎么解释

问题 您好，我想请教一下如果是十个样品分别用不同TMT标记然后混合只进了一针质谱应该怎么用MaxQuant搜库呢，我搜出来的感觉不太对，谢谢您。

文章 RGB、Lab色彩模型

几种主要色彩模型 RGB （见百度百科） RGB色彩模式是工业界的一种颜色标准，是通过对红(R)、绿(G)、蓝(B)三个颜色通道的变化以及它们相互之间的叠加来得到各式各样的颜色的，RGB即是代表红、绿、蓝三个通道的颜色。通常情...

文章 linux命令之sed

...辑器中见到的那些。 sed 把当前正在处理的行保存在一个临时缓存区中，这个缓存区称为模式空间或临时缓冲。sed 处理完模式空间中的行后（即在该行上执行 sed 命令后），就把改行发送到屏幕上（除非之前有命令删除这一...

问题 黄老师您好，我想通过染色体的两两共线性分析，将杨树中的19条染色体做个聚类分析，老师能给个分析思路吗，我不知道从哪里开始。

问题 老师 我在做blast比对时 由于速度太慢 我使用了diamond命令 但发现生成的表格比对序列的太多 我想提取比对最好的前5个 请问怎么用perl提取呢

问题 老师，我在提取gene_exon_info.gff文件提取时运行正常，但是提取的结果不完整是为什么？有200多个基因但只提取出来几十个基因的信息

问题 群体研究合辑work.sh脚本运行问题

在服务器上加载镜像reseq-v2.0运行work.sh脚本，前几个命令运行正常，# 数据质控：对原始序列进行去接头，删除低质量的reads等等，质控数据统计汇总：python $scriptdir/qc_stat.py -d $workdir/2.data_qc/ -o $workdir/2.data_qc/ -p all_sample_qc 运行报...

文章 基因组重复序列分类

...物基因组中频繁出现的相同或对称的DNA序列片段，其中单个相同的片段称为重复单元，占整个植物基因组的10%-85%。基因组中重复序列的比例及存在位置多样，从而推动植物基因组的进化。根据重复序列在植物基因组中的组织方...