... 解决 对gatk-4.6.2.0/gradle/wrapper下面的gradle-wrapper.properties这个文件进行更改，主要是更改这个文件的distributionUrl=一行，后面换成国内的镜像就可以了，我是用了阿里云的 distributionUrl=https\://mirrors.aliyun.com/gradle/distributions/v8.10.2/gr...
kaks计算用了很多种方法转换axt，最后计算都说不equal，查看序列都相同，也符合三的倍数，都含有ATG，但是就是不equal，查到老师说可以用notepad++手动转成axt，请问怎么转呢？
...示的是非同义替换（Ka）和同义替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 同义/非同义突变概念 同义突变表示氨基酸没有改变，氨基酸没有改变就不会影响蛋白质的结构的与功能...
...重要的角色，但已经从曾经的刷文利器跌落神坛，短读长这个缺点也不断受到诟病。转录组学的研究由谁来挽救？答案就是三代测序技术—单分子全长转录组测序。该测序技术可以直接得到全长转录本，无需组装，克服了二代测...
...gtf从gff3转换而来，使用到的软件是cufflinks-2.2.1/gffread，用这个版本的gffread进行转换的时候不会产生第三列没有transcript的行 解决方法： 采用v0.12.7版本的gffread，使用以下命令进行转换的时候，可以保留transcript这个type。 gffread -...
...g/nsegata/graphlan 然后将路径添加到bash配置文件中，之后就可以使用了。命令如下： export PATH=`pwd`/graphlan/:$PATH GraPhlAn 主程序 GraPhlAn有两个主要的脚本： graphlan_annotate.pygraphlan.py 其中第一个（graphlan_annotate.py）用于将注释文件绑...
...小巧方便，转换速度快。 跨平台，在Liunx下用，在win下也可以用(我也只在这两个平台下用过)。使用方式 使用前的准备 使用前一定要记得先下载安装才行，对于不同的操作系统可能会有需要设置环境变量的情况。如果你安装后...
...示文件： 有时Rstudio默认的文件打开编码格式不是UTF-8，可以通过File——Reopen with Encoding，修改显示文件的编码格式。 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，...
...的用户，都必须首先向系统管理员申请一个账号，然后以这个账号的身份进入系统。 用户的账号一方面可以帮助系统管理员对使用系统的用户进行跟踪，并控制他们对系统资源的访问；另一方面也可以帮助用户组织文件，并为...
...高，导致低表达量的基因几乎显示不出来： 这里我们可以利用graphpad的，Y轴断裂方法来使低表达量的基因也能显示高低变化如下所示： 具体的操作方法： 1、双击Y轴，选择“Two segments”；2、“Range”里面的length百分比是...
...10月左右首次下拨到各个依托单位，比例为60%左右。经费可以使用的时间一般是第二年的1月份开始，但是具体情况要根据各个单位相应的财务制度而定。 当然了，小编作为一个科技服务行业（更具体点应该是高通量测序技术服...
...的话，GATK提供了参数可以控制读取文件句柄的数量： 这个参数指定了当读取结束溢出到磁盘时保持打开的最大文件句柄数。一般情况下，设置的这个数字要比每个进程可打开的最大文件数量稍低一些。 所以我们在运行的...