你好我在你们服务器上没有找到泛基因组分析用的nt 数据库,
...前文件夹下有两个txt文件1.txt、2.txt,该命令报错原因是不符合find的书写规范,上述命令被理解为: find ./ -name 1.txt 2.txt 而"-name"参数后仅能接一个文件,因此正确书写时应在待查找的文件名两侧加单或双引号: find ./ -name "*txt"...
老师您好,我在左PCA分析时,如果发现几个样本没有按照实验设计分出来,我想把这几个给去掉,怎么能找出来呢?PCA图上也没有标注,麻烦老师了!
老师你好,想问下二代数据质控中GC content出现双峰除了污染,还有其他可能吗?和基因组杂合度有关吗?我分析了7 8 个不同物种,不同平台的下机数据,都报错。
...提出进废退理论。他说生物经常使用的器官会逐渐发达,不经常使用的器官会逐渐退化。而且这种后天获得的性状是可以遗传的,因此生物可以把后天锻炼的成果遗传给下一代。达尔文认为,所有的生物物种都存在趋利的适应性...
经常遇到不同的数据库,采用不同的基因ID ,要想联合分析,需要统一ID,这就涉及到到ID的转换,介绍几个ID转换的网站: 1. UniProt ID mapping 2. DAVID 3. bioDBnet
请问比对结果中大于一次的是否可用?是不是所有的分析都只能用唯一比对的地方? 为什么bowtie带有仅保留唯一比对,但是bowtie2取消了这个参数? 谢谢您的回答。
老师您好,我分析的基因家族的一个成员是未挂载到染色体上(MdoScaf049s0015),由于该成员所在的sca长度太短,绘制的圈图显示如下,这样是正常的吗?
...f | xargs -I {} ln -s {} /目标目录路径 2.使用循环: 如果你不想使用 find 和 xargs,你可以在脚本中使用循环逐个创建链接。对于非常大量的文件,这可能效率较低,但可以确保不超过参数限制。 for file in /要链接的文件路径/*; do ...
泛基因家族分析练习时,按老师贴的命令运行docker ,出现了如图报错,不知问题出在哪里?该如何解决
请问基因家族成员的个数有确切的要求吗?我的基因家族数目严格的来算的话只有13个,这样进行基因家族分析会不会因为数目太少被拒?
...conserved domain 得到 点击进去得到的跟您那个NB-ARC的例子不一样 显示这样的,我搜索的domain 是一个超家族的成员,那么再进去是这个超家族的pfam号,这个号可以用来在我需要的物种中研究我的这个基因家族吗?
老师,您好,我用GEO数据库的表达矩阵做WGCNA分析,总共34个样,表达矩阵中有60000多个基因,基因太多,如何进行筛选?WGCNA是否有处理这样大量数据的方法?
....fa文件内容: 初步断定是我的ensemble文件出了问题。但不清楚具体问题在哪,或者我需要怎么整理?请老师告知。付费讲解也可以。谢谢!
分析甲基化数据需要标准化吗?用什么方法