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文章 pyvcf的安装

...是直接安装会报错这里可以看出来,pyvcf的安装包竟然还使用python2编写,因此为了使用它,需要用到use_2to3这个小模块,毫无疑问,这也是一个相当老的模块,因此无法最新版的setuptools上使用,因此我们可以先将setuptoos降级...

问题 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

老师,请问我进行疾病与正常对照的微生态群落分析,环境因子中无法设置连续变量值,是否可填入0、1进行分组分析呢?或者应该如何进行这类的网络分析?

问题 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

老师,请问我进行疾病与正常对照的微生态群落分析,环境因子中无法设置连续变量值,是否可填入0、1进行分组分析呢?或者应该如何进行这类的网络分析?

文章 利用sed 命令去掉windows下回车符

Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其linux中显示为^M,使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed  -i 's/^M//g'  test.txt    ^M 是回车换行符,输入方法是按住CTRL+v,松开v,按m

问题 TCGA分析

TCGA筛选出来的差异基因绘制火山图的时候出现这样的提示,是什么原因呢?怎么解决,对后面分析有影响吗?

问题 修改样本名称

我用bcftools 修改样本名称的时候,出现下面的错误,我质控后怎么显示这个文件不是 gzip-compressed 的文件那?

问题 使用promo网站分析动物顺式作用元件遇到问题

老师好,我使用promo网站分析动物顺式作用原件时,物种分类里没有我的物种,就选择了较近的分纲,得出的数据放入tbtools可视化得到的图片好奇怪,密密麻麻的,是不是有哪里出问题了。

问题 GO层级整理

老师,请教一下,要怎么将GO terms 的层级信息整理出来,类似这样 待整理表格如下

问题 结构域建树

家族里的成员大多数有两个相同的结构域,而有些成员只有一个结构域,那么建树的时候应该怎么截取结构域呢?

问题 服务器

老师实验室最近配置了服务器,我有个疑问,怎么可以像虚拟机那样跟本地可以挂载,习惯了虚拟机了我也是

问题 motif展示

老师您好,我想问问做motif分析的时候,结果里把1个结构域给分成2个motif呈现,这种问题该怎么解决呢?

文章 TCGA 临床随访信息follow up 各列介绍:

TCGA 临床随访信息各列查询:https://docs.gdc.cancer.gov/Data_Dictionary/viewer/#?view=table-definition-view&id=follow_up  typeproject_idsubmitter_idcases.submitter_iddiagnoses.submitter_iddays_to_follow_upadverse_eventadverse_event_gradeaids_risk_factorsbarretts_esophagus_goblet_ce...

问题 biolinux

导入之后设置的时候发现无效设置。 显示硬件配置页中已启用硬件虚拟化,但主机并不支持,需要禁用硬件虚拟化才能启动虚拟机。是什么意思?怎么处理?谢谢解答

问题 WGCNA

老师您好,我做WGCNA的时候 做出可视化热图是反的  像下图这样 周围颜色深 中间颜色浅  我看到很多人都遇到这个问题,但是都没有解决方法 请问是怎么解决 

问题 提取保守结构域

我做的的家族分歧比较大 ,需要用结构域建树,不知道怎么操作,希望老师能详细说下