老师,我在做Mapchart绘制基因染色体位置图时遇到下面的问题,这是Date,这个是生成的图,chr2为什么显示不出来呢,当我修改了染色体长度为210965212后,就可以显示出来,怎么解决这个问题呢,谢谢
...查变量时,运行‘ll $workdir’和‘ll $scriptsdir’显示变量不存在,运行‘echo $ref’成功,从昨天晚上开始试了很多遍都是这样,请问老师怎么解决?辛苦您了,谢谢。
...目录连接的原始文件或目录; -f:强行复制文件或目录,不论目标文件或目录是否已存在; -i:覆盖既有文件之前先询问用户; -l:对源文件建立硬连接,而非复制文件; -p:保留源文件或目录的属性; -R/r:递归处理,将指定...
...(list_str) #方法3 list_str = [v for v in str_x] print(list_str) (5)列表转字符串,list 转 arraylist1 = ['a','b','c']#方法1str1 = ''.join(list1)print(str1)#方法2list2 = [str(i) for i in list1] # 创建变量i循环list1 然后赋值给str(i)str1 = ''.join(list2)print(str1)(...
...如下命令进行操作: 如果我们对压缩文件夹的目录构成不清楚的话,可以使用tar tvf指令进行查看: tar tvf file.tar 比如我们需要从中提取某个MD5文件,那么执行如下指令: tar xvf 1.tar ./MD5/file.md5
我按照教程执行命令,想借此下载自己感兴趣的数据 在执行到GDC下载这一步,突然出现下载数据找不到,而出现下载中断,无法继 还有个问题,查询到的样品数目为何和癌症和癌旁样本加起来不一样。。。。少的去哪里了
如图所示,染色体排序不太正确:
然后这里我更改了酶切位点改为2以后能生成11个文件,但是得到的热图和之前老师发的文章的图不一样这是我的命令以及排查的操作
这个和拟南芥的GFF3文件的东西不一样,是不是不能用mRNAid_to_geneid.pl这个脚本了。。
...当中,每一个K值柱状图下面的样品顺序都是相同的,能不能直接在最下面或者最上面显示样品名而不是在每个图下面显示,代码因该如何修改 这个是绘图的代码 p<-plotQ(qlist,imgoutput="join",#showlegend=T,returnplot=T,exportplot=F,quiet=T,ba...
...于真核生物全基因组测序来说,转录 组测序得到的序列不含有内含子及其它非编码序列,因此 转录组 测序有着无可比拟的高性价比优势
...细胞ID与count矩阵中的细胞ID一致,无需做处理 单细胞分析: #count数据和metadata数据无需解压可直接读入 Rscript $scripts/seurat_sc_qc.r \ --count GSE149614_HCC.scRNAseq.S71915.count.txt.gz \ --metadata GSE149614_HCC.metadata.updated.txt.gz \ --nUMI.min 500...
我已经设置了粘贴板双向共享,但是还是没法把windows里的文字粘贴到linux系统里,不知道为什么??
...ort matplotlibmatplotlib.use('Agg') 当然,很多时候这个脚本并不是你编写的,那就不要贸然更改 如果你的系统里有xvfb,(用wiich查看) xvfb-run 后接你的命令就可以了 没有的话可以尝试使用matplotlib的非交互模式,将matplotlib配置...
...步支持,又尝试了bcftools -c可是这个建立的索引CombineGVCFs不识别)