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问题 使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

您好,我在使用tassel进行排序时报错,知道为什么会有负深度

文章 吐血推荐!来自科研老司机的国庆7天出游指南!

...祖国母亲生日的时候还在埋头苦学呢? 是因为无聊吗?! 是心中对导师的眷恋、对事业的追求、更是对科研的爱好啊!!! 然而,该出去玩还是得出去, 长假好容易1年只有1次,你也需要好好考虑这漫漫长假如何度过...

问题 公司的结题报告中,出现一个lncRNA有多种外显子情况

老师,您好。最近在做lncRNA分析,看了公司的结题报告,出现一个lncRNA转录本对应多种外显子个数的情况。 比如lncRNA1,有1个外显子,也有5个外显子的情况,就很困惑,他到底是有1个还是5个? 请问,这是为什么呢? 谢谢!

问题 利用tassel生成曼哈顿图的时候出error

...samtools生成的,用的表型和基因型vcf也是我自己的文件,分析也能出结果,但是出了曼哈顿图,麻烦您啦

文章 基因(加性、显性、上位性)效应

...豆。 基因的上位性效应(Epistatic effect) 用I表示 指的是由同基因位点的非等位基因之间相互作用对基因型值所产生的效应 也是非加性与杂种优势有关。 上位性又可以简单地分为 加加上位性AA 加显上位性AD 显显上位性DD 其实我...

文章 肾病最新研究进展:通过生物标志物检测进行早期预测和干预

...。 文中的主人公才27岁,是一名年轻的程序员,他结婚久,本该前途无限,对生活抱着无限的憧憬和希望,但是因为一次体检,就把这些美好全部打碎,主人公患上了二级高血压和慢性肾病一期。 这位年轻人的遭遇是个例...

文章 带推断线的进化树

...ts(opt$consensus)) {  stop("错误: 共识树文件 '", opt$consensus, "' 存在!")}if (!file.exists(opt$bootstrap)) {  stop("错误: 自举树文件 '", opt$bootstrap, "' 存在!")}cat("正在读取共识树文件:", opt$consensus, "\n")consensus_tree <- read.tree(opt$consensus)cat("正...

文章 分享转录组学与新一代高通量测序PPT讲义

...据常见的存储格式 2、通过实例了解转录组和miRNA的数据 分析思路及常用方法 • RNA-seq Transcriptome Technology • RNA-seq Data Format • RNA-seq Data Analysis Strategy • Case Report

文章 BaiduPCS-Go 使用小技巧

...<提取码> 注意: 转存文件保存到当前工作目录下, 支持指定. 例子 BaiduPCS-Go transfer https://pan.baidu.com/s/12L_ZZVNxz5f_2CccoyyVrW?pwd=edv4 5. 下文件更改保存文件夹 config set --savedir 自己想保存的文件夹BaiduPCS-Go d 网盘文件 ...

问题 #运行MCSCANX 查找共线性 /biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT 出错

老师 共线性分析没结果!可是用拟南芥的就可以 是是我文件的问题啊?我检查了也没检查出来问题。麻烦帮我看一下 谢谢!

问题 用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的,是为什么呢

...,ident2是ctrl),也尝试调整pvalue和logfc去跑gsea,结果差太多 桌面版GSEA是输入了average expression的文件 很多标志性的通路在enrichGSEA跟我们的预期都是反的,而在桌面版的结果又是符合我们预期的。 当然并是全部通路都是相...

文章 细胞STR鉴定有用吗?发论文一定要做STR鉴定吗?

...重——   1、浪费时间和科研经费;   2、实验结果可重复、科研结果可靠;   3、会被学术期刊拒收或撤稿。   据统计,目前有超过30%的细胞系被错误辨识或受到交叉感染。   2010年《国际癌症杂志》(IJC)统计出...

问题 hmm文件搜索问题

你好,我做小麦基因家族分析时筛选得到的Terpene_synth_C_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt这个文件的基因是141个,运行下面的命令,得到的Terpene_synth_C_domain_new_out_removed_redundant.txt这个文件怎么是147个?谢谢老师 ! manager@bl8vbox[ge...

问题 请问 报错Error in parse(text = x, keep.source = FALSE) : 该如何修正

在进行单因素COX分析时输入第一个变量就报错了,请问是什么原因呢?谢谢

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 数据合并

...ex  构建的index 文件(pbi后缀)非常的重要,因为后面的分析中,有些步骤虽然采用的是subreads.bam 文件,但是如果没有index 的pbi 文件,命令执行就会失败,而且没有提示(大坑)。