文章 perl 中 $#ARGV 是什么意思

...个数减一，即数组@ARGV最后一个元素的索引。用处也就是在程序开始时判断命令行参数个数，或者直接操作最后一个命令行参数。官方文档说明： The array @ARGV contains the command-line arguments intended for the script. $#ARGV is generally the number...

问题 系统发育树美化出现错误

原本在MEGA11上分支是对的，但现在在evolview美化上分支出现错误，导致一个点有三个分支

问题 利用gff文件提取基因结构，结果文件是空的

...件是空的 这是ID 这是脚本文件 Sirius21小时前 use Getopt::Long;my %opts;use Data::Dumper;GetOptions( \%opts, "in1=s", "in2=s", "out=s", "h" );if (   !defined( $opts{in1} )|| !defined( $opts{in2} )|| !defined( $opts{out} )|| defined( $opts{h} ) ){&USAGE;}open( IN1, "$opts{i...

文章 siRNA

...碱基，通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰（RNAi） 在RNA干扰通路中，siRNA 通过与互补 mRNA 分子杂交干扰基因表达。这种干扰会触发 mRNA 降解，进而抑制特定基因的基因表达。 人工合成siRNA siRNA 于 1999 年由 David Baulcomb 实验...

问题 docker后台如何运行命令

在使用docker镜像的时候，有的命令必须长时间运行，比如bwa比对，如何挂载在后台运行，就是那种退出服务器，命令还能运行。

问题 想问一下大家做蛋白质谱搜库分析的时候用maxquant我原始文件是wife.scan格式的不是raw格式的用此软件可以吗，因为看到在选项里面是有wiff的，但是我发现最后性能那里不能得到结果，显示报错，想问有没有大神可以解答一下呀多谢多谢

问题 老师，为什么我找的家族在本物种里的结构域会这么少呢？换了个物种也是一样的情况，甚至更少了，一个原因是事实情况就是如此，只能换家族，另一个会不会是我操作有问题呢？第二张图是我的历史代码，麻烦老师帮忙看看

问题 MAGEcc跑进化树

老师您好！我用linux的megacc构建进化树，在.mao文件中设置的线程数是最大值40，然而，在运行过程中，一直只是一个线程运行，实在太慢了。请问这是咋回事？

文章 KEGG数据库-蛋白序列文件下载

...用曾经免费的那版本，一直没有更新。由于现代测序技术和信息技术的发展，KEGG数据库有很多的更新，所以更新KEGG数据库是非常有必要的，一般来说需要更新的信息包括，蛋白序列，蛋白对应的pathway, pathway相关注释文件等。 1...

问题 进化树美化问题

在进化树美化中设置branch color，bg color时，输入指令的时候基因名称没有下划线（比如XP 020701573.1）也可以输出结果，但为什么在加入分组的时候必须把下划线加上（XP_020701573.1）才能正常显示？

问题 各位大佬好！我在筛选一批转录组数据里的差异基因时，当进行到构建dds对象的时候，r语言出现以下报错，说“一些值不是整数”，当我上网查这个错误的时候，有人说是“数据已进行归一化，无法进行DESeq2分析”，请问各位大佬，还有什么解决方法嘛？？谢谢谢谢

问题 蛋白3D结构预测

老师您好，您看我用的同一个氨基酸序列，第一张图是先用psi-blast,py然后在swissmodel生成的模型。第二张是直接在swissmodel上生成的模型，看结果是不是应该选择第二个。

问题 我想问一下在进行WGD分析时，要算复制时间，基于物种进化速率的公式：The divergent time of the whole-genome triplication (WGT) event was calculated using the formula divergence dateKs / 2r.

Based on the divergent time (77 million years ago) between F. americana and C. canephora and the mean Ks value (1.36) of syntenic gene pairs between F. americana and C. canephora, it estimated 8.83 × 10−9 substitutions per site per year of synonymous nucleotide substitutions rate (r) fo...

问题 比较基因组数据分类

老师我想知道我做比较基因组的韦恩图数据在哪个文件里，我想知道我做的物种里特有的基因家族但是我不知道在哪个文件里

问题 老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的