我按照简书上的基因家族分析步骤，分析两个物种的共线性。已经得到了merge的blast结果和gff结果，使用Quick Mscanx Wrapper的时候总是得不到结果，只能得到两个merge之的文件的副本。这是结果和参数图。
...，删除了几条短得没有比对到这部分的基因序列。这样就不准确了么。那短一点的序列该怎么建树呢？
...快，而且cd-hit这软件也是比较经典的一款软件，在转录组分析中经常用到 1.2 结果容易理解： 该软件就只是简单的基于序列的相似性，进行转录本的合并，转录本的ID都不会变动。 2. 缺点： 2.1 无法区分那...
就是这样的图，我看分析流程根据方法下载了转录组数据，有作图的教程，没有说怎么结合基因家族分析，数据怎么处理。
...准化原始数据中，每个基因表达变化范围对应的数值大小不同，导致图片中色彩变化难以显示基因在不同样本中的变化趋势，可以对基因在每个样本中基因表达数据进行标准化，使其数值在一定范围内，从而实现热图的优化，而...
老师我在学习了咱们课程后可以做出两个物种的共线性图，但是我在看文献都是这种多个物种放在一起的图，我自己琢磨不明白是怎么做的，希望老师帮我解答
老师： 您好！我想做基因芯片方面的数据挖掘，是新手；但是看了一下芯片数据，探针对应的基因似乎不全，请问这种数据真的能使用吗？有价值吗？ 这是用R语言做的芯片图：
...mkfastq 产生，下面的例子是两个样本同一个lane测序拆分后分析；第二个例子是同一个样本两个lane测序，需要合并一起分析； 大家注意文件命名方式，蓝色和红色部分； cellranger命名规则 : https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene...
按照教程进行，共享文件夹创建成功了，但是把拟南芥的fa文件复制进去之后我在power shell里用ll指令没有找到拟南芥的fa文件，请问这是怎么回事？使用ls指令也是只有显示文件夹不显示文件
...师，群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP，那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢？在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总...
老师，您好！ 我近期构建了一只进化树，但是分类方面感觉面临一些问题；不知道如何分类好，树的体量比较庞大。有没有相关的软件呢？ 附上树的附件： testtree1_wag.nwk
老师，你好 我在分析基因家族中串联重复基因的时候发现我对串联重复基因的定义有点疑问 但是我在视频中看到的筛选串联重复基因和计算kaks时看到 我也看了相关的文献应该是有具体的位置距离限制，但是我在想后面这个...
老师你好，我在学习基因家族分析（生物信息）这么课程，在学习的过程中遇见了一个问题。今天正好学习到提取蛋白Motif这块内容，按照老师的讲解，同时一步一步的操作。在里面使用到一个meme命令的时候，系统提示我...
...，大部分实验室负担得起； 4、可完全替代实验室现有75%酒精等杀菌剂的使用； 5、抑菌效果好：高效清除细菌以及紫外线杀灭不了的真菌及其孢子，尤其适用于梅雨季节。 另外，Room SafeGuard除了可以对细胞房进行整体的除菌...
NW_011935983 下 既预测了XP_011438324 也预测XP_011438325 建树时我该怎么取舍 尤其是两者序列不一样的时候