我现在在做一个比较常见的基因家族分析，我鉴定到我的物种的家族成员有点多，普通序列建树无法成功，需要做结构域建树，想请教下结构域建树的方法。
你好我在你们服务器上没有找到泛基因组分析用的nt 数据库，
...前文件夹下有两个txt文件1.txt、2.txt，该命令报错原因是不符合find的书写规范，上述命令被理解为： find ./ -name 1.txt 2.txt 而"-name"参数后仅能接一个文件，因此正确书写时应在待查找的文件名两侧加单或双引号： find ./ -name "*txt"...
老师您好，我在左PCA分析时，如果发现几个样本没有按照实验设计分出来，我想把这几个给去掉，怎么能找出来呢？PCA图上也没有标注，麻烦老师了！
不管是重测序或者是有参转录组，很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说，常用比对软件都可以正常运行结束，但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题，这些问题有的时候是参考基因组索引建立...
老师你好，想问下二代数据质控中GC content出现双峰除了污染，还有其他可能吗？和基因组杂合度有关吗？我分析了7 8 个不同物种，不同平台的下机数据，都报错。
...提出进废退理论。他说生物经常使用的器官会逐渐发达，不经常使用的器官会逐渐退化。而且这种后天获得的性状是可以遗传的，因此生物可以把后天锻炼的成果遗传给下一代。达尔文认为，所有的生物物种都存在趋利的适应性...
经常遇到不同的数据库，采用不同的基因ID ，要想联合分析，需要统一ID，这就涉及到到ID的转换，介绍几个ID转换的网站: 1. UniProt ID mapping 2. DAVID 3. bioDBnet
请问比对结果中大于一次的是否可用？是不是所有的分析都只能用唯一比对的地方？ 为什么bowtie带有仅保留唯一比对，但是bowtie2取消了这个参数？ 谢谢您的回答。
老师您好，我分析的基因家族的一个成员是未挂载到染色体上（MdoScaf049s0015），由于该成员所在的sca长度太短，绘制的圈图显示如下，这样是正常的吗？
...f | xargs -I {} ln -s {} /目标目录路径 2.使用循环： 如果你不想使用 find 和 xargs，你可以在脚本中使用循环逐个创建链接。对于非常大量的文件，这可能效率较低，但可以确保不超过参数限制。 for file in /要链接的文件路径/*; do ...
泛基因家族分析练习时，按老师贴的命令运行docker ,出现了如图报错，不知问题出在哪里？该如何解决
请问基因家族成员的个数有确切的要求吗？我的基因家族数目严格的来算的话只有13个，这样进行基因家族分析会不会因为数目太少被拒？
...conserved domain 得到 点击进去得到的跟您那个NB-ARC的例子不一样 显示这样的，我搜索的domain 是一个超家族的成员，那么再进去是这个超家族的pfam号，这个号可以用来在我需要的物种中研究我的这个基因家族吗？
老师，您好，我用GEO数据库的表达矩阵做WGCNA分析，总共34个样，表达矩阵中有60000多个基因，基因太多，如何进行筛选？WGCNA是否有处理这样大量数据的方法？