老师您好，请问，两组数据每组2个样品，对比差异基因，应该用什么方法？我看说的limma包至少每组要3个样品，不知道2个应该怎么对比
...展成熟的MK-iPSC之后，iPLAT中敲除B2M（A，B）。流式细胞仪分析生成的CD41a + CD42b + iPLAT，以及imMKCL，iPLAT，JRC血小板和K562细胞（C，D和E）上B2M和HLA-ABC和HLA-E的细胞表面表达。 基因点突变iPSC的研究案例： 通过CRISPR/Cas9和iPS细胞...
...-A3-3323KIRC --mclust 是否对样本进行聚类 第一次运行脚本不进行聚类，通过返回的BIC（贝叶斯信息判别标准）结果选择合适的聚类数和模型类别 -n 输入选择的模型类别 mclust包中提供了14种模型（EII、VII、EEI、VEI、EVI、VVI、EEE、...
做热图时颜色变化不明显，想把数据重据转化成下第二个图的样子。(两幅图是同一份数据）
利用谷子的基因号（来自于JGI数据库）例如 seita.1G36240 这种形式的 基因ID . 在第一步时：输入上面的基因ID号，不知道选择什么形式 进行 检索
您好！ 最近遇到了一个跨领域问题，百思不得其解。有一个数据集它包含30个基因序列，我用mega软件即使每次选择不同的建树方式也只能得到四棵不同进化树，但我在GitHub上看到一个项目MO-Phylogenetics，它里面的一个基因序列数...
...文件中的y那列扩大，好像只能是0-9之间的一位数数字，不能写两位数数字，但是我比较的物种有七个，画的图感觉特别拥挤， 不知道老师有没有什么好办法能扩大一下整张图，我在官网和其他网站都没找到类似的回答，感谢老...
老师我在服务器里用咱们的镜像做索引时gene_length文件出错了，我找了相关的问题回答，但是不知道这个脚本应该修改哪里才好
基因在染色体上定位 这个是最新的吧 不知道如何用 查资料都是以前的
...运行，发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5个文件并没有出现。不知道问题出在哪里
在基因家族分析课上，可以通过blast得到基因家族成员。我想通过拟南芥的蛋白序列获取其他物种的基因家族成员，我通过pfam的sequence search，输入拟南芥的蛋白序列，得到了几个pfam的编号，可以得到隐马尔科夫模型。我可以将...
老师您好，我在fasttree建树时遇到了这样的问题，一共是566个个体，之前用其中的328个个体建树时是成功的，增加后就不可以了，用我们的服务器试过了，报了同样的错 请问是什么原因呀？
...manager: rm: cannot remove ‘temp7734.*’: No such file or directory 不知道什么原因？问了一个月了没有任何回复
再利用vennerable包VennThemes函数时，我不知道怎么分face，因为三维及以上，其交集的个数很多，请教大家一下！
...否有基因吗，获得基因编号后要去什么文件中进行检索，不知道文章中曼哈顿图上标注的基因都是怎么来的，求助