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文章 组建专属KEGG数据库

前情提要: GWAS关联到的基因做KEGG富集,竟然全,显著。所以听人劝,试试自己做一个自己物种的。 正文: step1: https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main  KEGG注释的网址 step2:模仿下图填空  ps 上传文件有点慢呀  (找个断网...

问题 基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

...些基因我怎么取舍呢? 如果62个基因都拿来进行下一步分析吗,命名有什么规则吗?我做的是SBP家族,是根据我的unigene的名称排序依次命名呢?还是先将这些基因和拟南芥的SBP基因构建进化树,根据进化树分类结果命名? ...

问题 使用GSDS绘制基因结构图时,显示界面缺少更改图例的图标

老师您好,我在用GSDS作图出来后,黑笔圈出来的按键部分一直显示,改变了图片信息。

文章 生化检测是什么?生化检测试剂盒该怎么选?

...定肌酐 20世纪30年代,光电比色计法出现 20世纪50年代,分析技术如离心、层析、电泳、免疫分析、光谱分析、电化学发光等技术出现 20世纪70年代,放射免疫分析技术、化学发光技术和电化学发光技术快速发展 20世纪80年代,...

文章 linux中进程状态

...眠中, 受阻, 在等待某个条件的形成或接受到信号)  3. 可中断(收到信号唤醒和可运行, 进程必须等待直到有中断发生)   4. 僵死(进程已终止, 但进程描述符存在, 直到父进程调用wait4()系统调用后释放)   5. 停止(进程收到S...

文章 使用Dockerfile制作生物信息分析基础镜像

使用 Dockerfile 定制镜像 从刚才的 docker commit 的学习中,我们可以了解到,镜像的定制实际上就是定制每一层所添加的配置、文件。如果我们可以把每一层修改、安装、构建、操作的命令都写入一个脚本,用这个脚本来构建、...

问题 关于如何确定segmental duplication events

...形式表达出来,那么请问老师在这些基因对中如何确定是是segmental duplication events呢,是是说在比对基因组过程中所有比对出来的同源基因都是属于segmental duplication events?请老师辛苦做出详细解答,对于这一概念确实有些...

问题 三代转录组和二代转录组取样上有什么区别吗?

我有一些材料,需要混样做一个三代全长转录组,同时每个样品还得做二代转录组,就是知道取样上有没有什么区别呢?

文章 地球上物种总数到底有多少??

...使用比例定律(scaling law)和一种生物多样性模型的混合分析方法对微生物总数进行了预估,结论是地球上的微生物物种总数约为 100000000000~1000000000000之间贴心的我已经帮你数好0了,总数在一千亿到一万亿之间(研究结果刊发...

文章 BaiduPCS-Go 无法上传文件的问题

...文件的时候,突然有一天无法上传了,卡在准备上传的界面动了, 经过排查,发现 ~/.config/BaiduPCS-Go 目录中的 pcs_uploading.json这个文件异常的大,可能是因为上传错误的累积等原因导致他一直没有清空,我们只需要手动删除这个文件...

文章 Linux Shell 编程基础 简化自己的工作批量运行命令

...自定义变量 定义变量需要注意下面 2 点: 1. 等号前后要有空格:NUM=10 2. 一般变量名用大写:M=1 使用 $VAR 调用变量: VAR="Hello Shell" echo $VAR 注意:变量定义直接给变量取名字,字符串中有空格等特殊字符需要用引号引...

问题 HGMD数据库

... mutation的文章倒是好写,但是易感突变在临床上其实意义大,我们始终想在临床上把这些患者家系给诊断清楚,经过层层筛选后我们一个家系能得到1000个rare mutations,一个个去HGMD上检索似乎太现实,这方面进展缓慢。 您要...

问题 用perl脚本提取顺势作用元件的序列是显示zsh: killed ,是因为内存够吗?

我根着组学大讲堂中基因家族分析的流程做,用小麦最新参考基因组分析,做到提取基因的上游1500bp时,显示out of memory,然后我修改了虚拟机内存,再运行还是同样问题。于是我想可能是小麦基因组太大,所以我单独提取了每条...

文章 perl中的列表与数组

...rray是同一个数组,但是(1,2,3,4)和(5,6,7,8)是同的列表指的是具体的数据,而数组只是一个变量,可以存放同的列表  一、列表 列表是包含在括号里的一序列的值,可以为任何数值,也可为空,如:(1, 5.3 , "...

问题 老师您好!请问怎么在mapchart画连锁图时加标尺

老师您好!我画的图小于200Mb的可以标出基因在染色体的具体位置,但是基因在染色体上的位置大于200Mb的基因画出来。new 1.txt谢谢您!