...perl里面的一个列表筛选函数，功能还是不错的。 grep有2种表达方式: 1. grep BLOCK LIST 2. grep EXPR, LIST BLOCK表示一个code块,通常用{}表示;EXPR表示一个表达式,通常是正则表达式。LIST是要匹配的列表。 示例： 统计匹配表达式...
在NCBI网站上，同一个SAMN具有多个SRR文件，如何将这些下载下来的多个fastq文件合并成一个文件，并且最后获得read_1和read_2文件
...ple_type <- "Primary solid Tumor" > legacy <- FALSE > # 工作目录如果不存在，则创建目录 > if( !file.exists(work_dir) ){ + if( !dir.create(work_dir, showWarnings = FALSE, recursive = TRUE) ){ + stop(paste("dir.create failed: outdir=",work_dir,sep=""))...
...好了：下载地址：https://www.virtualbox.org/wiki/Downloads 1.2 下载centos7系统iso文件： 海量的高通量测序数据，windows是处理不了的。因此果断选择linux服务器，开源免费而且生物数据分析软件也免费。这里选择CentOS版本的linux作为服...
...题，具体如下：运行这个脚本：perl $scriptsdir/ProtExcluder1.2/ProtExcluder.pl ${lib}_blast_results.txt ${lib}，会显示ProtExcluder1.2/这个文件夹里的多个脚本有权限问题，可是我并没有运行有权限问题的脚本。其次，这些脚本为什么会存在权限问...
...列时，biolinux系统运行脚本失败。 基因位置信息如下 XP_016539240.1 NC_029984.1 140133542 140145037 +XP_016549783.1 NC_029988.1 2729089 2737473 +XP_016550150.1 NC_029988.1 148442883 148468095 +XP_016553914.1 ...
...豁然开朗。 3，换一个简单的方式 面对高强度的研究工作，遇到失败是正常的， 你可以在碰到特别棘手的事情时，同时去做一些更简单、更有可能得出积极结果的事情， 比如一个小小的实验、或者一次小长跑等等。 即使...
...CD4+FOXP3+调节性T细胞在白斑中扩增并在胶原刺激下表达LAIR2，这可能为肿瘤进展提供有利的微环境。总之，基质和免疫细胞相互作用在 HNSCC 的逐步进展中发挥着关键作用，我们已经确定了 HNSCC 进展过程中可能的治疗干预措施的步...
...，不知道出自哪里，暂且一看： 0.1以下 没有关系 0.10-0.29 微弱关系 0.30-0.49 中等关系 0.50以上 强关联 pearson相关系数使用时需要注意的一些情况： XY联合分布符合正太分布 对异常点敏感 只有X和Y完全线性相关的时候，pearson系数...
...样资源情况下，良好的项目管理可以提高项目完成质量和工作效率、避免延期或者缩短项目完成时间。今天聊一些实战经验，略偏重 IT 开发项目，也是我们基于在线和远程办公的一点思考。 远程办公改变了组织和团队的形式...
...hits found是3即得到3个Thioredoxin domain: thioredoxin、thioredoxin_2、thioredoxin_9，但是序列范围重叠,72-174、85-172、64-173，是什么情况？实际这个蛋白序列中只有一个thioredoxin domain吗？ 用NCBI-CDD搜索的结果类似，也是给出multi-dom，但是序列...
...iime/pick_de_novo_otus/rep_set/qiime_rep_set.fasta rep_set.farm -rf picrust2_outpicrust2_pipeline.py -s rep_set.fa -i $workdir/5.pick_otu_qiime/pick_de_novo_otus/otu_table.biom -o picrust2_out --processes 1 --in_traits COG,EC,KO,PFAM,TIGRFAMadd_descriptions.py -i picrust2_out/EC_metagenome_out/pre...