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问题 lr2rmats软件

您好，lr2rmats这个软件您使用过吗？已按照要求进行安装，测试文件报错，想请您帮助解决一下。下图是测试文件出现的报错，不知道该如何解决，谢谢！

问题 您好，想问一下苹果电脑的powershell怎么导入数据？

您好，想问一下～苹果电脑的powershell怎么导入数据？因为苹果电脑就一个盘，不知道该怎么编辑代码～谢谢～

问题 纯生信的基因家族文章，比较推荐投什么期刊?

纯生信的基因家族文章是不是不太好投啊，要投的话有什么推荐的期刊吗？

问题 NGS数据分析时，使用ANNOVAR的table_annovar.pl报错。

使用自建数据库。用ANNOVAR的annotate_variation.pl进行注释时，没有报错。 [*****@head ****]$ perl ../tessDSS/annovar/annotate_variation.pl -geneanno -buildver HP ./bin/M5-31.avinput HPdb/NOTICE: Output files are written to ./bin/M5-31.avinput.variant_function, ./bin/M5-31.avinput....

问题 对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢？

因为数据有正负之分，此时直接求比值就不能够体现出二者的大小差异，可以作差比较吗？

问题 在运行命令时出现segmentation default

在重新下载过一个软件后发现在miniconda的bin目录下运行就会报错segmentation default，在其他位置就好了。 在运行admixture命令时也出现了这种情况，但是admixture官网已经不维护了，请问现在如何下载admixture？

问题 ssh登录服务器容易断连

ssh方式登录共享服务器，一定时间下不输入命令（比如在等命令完成）就断连接报“send disconnect: Broken pipe”；比起我在用的另一个服务器断连时间快太多了，有无方法可以解决这个问题？

问题 core_pan_gene_curve.r 运行时报错

动植物泛基因组分析：03.gene_family_pav分析自己的数据时，运行命令Rscript $scriptsdir/core_pan_gene_curve.r -i Orthogroups_PAV.tsv   --prefix core_pan_curve 出现以下报错信息 运行终止后，生成的结果文件如下 尝试从demo数据中cp Orthogroups_PAV.t...

文章 linux设置磁盘自动挂载

...常使用defaults就可以 第5列设置是否使用dump备份，置0为不备份，置1，2为备份，但2的备份重要性比1小 第6列设置是否开机的时候使用fsck检验所挂载的磁盘，置0为不检验，置1，2为检验，但置2盘比置1的盘晚检验。 将上面的命...

问题 iqtree2不报错，自动停止运行。

老师好，在用iqtree2构建进化树时，出现不报错自动停止运行，是在租用咱们组学大讲堂的服务器上跑的，内存有375G，supergene.npy文件有5.8G大小。以下是iqtree.log具体截图。

文章 DEG_limma.R 差异基因分析limma

使用方法: $Rscript DEG_limma.R -h usage: DEG_limma.R [-h] -e filepath -m filepath -t treatname --control CONTROL --case CASE [-f fdr] [-c fc] [-s size] [-a alpha] [-X x.lab] [-Y y.lab] [-T title] [-H height] [-W width] [-o path] [-p prefi...

文章 WGCNA剔除异常样本

做WGCNA分析，需要对基因和样本进行一定的筛选。一般来说，会采用如下的筛选方案： 1.  筛选掉基因表达丰低， 在各个样本中变化不大的基因 2. 筛选掉异常的样本 基因的筛选，比较好处理。但是异常样本比较难办，可以参...

问题 染色体挂载，bwa比对问题

您好，根据基基因组装与注释课程，我在做自己物种染色体挂载时，使用bwa aln 和bwa sampe 参数，提示 Unmatched SAI magic. Please re-run `aln' with the same version of bwa. 重装软件也不管用，这种情况怎么解决？

问题 SNP数据统计

...师，群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP，那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢？在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总...

问题 SNP数据统计

...师，群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP，那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢？在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP，但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总...