问题 老师，我想问一下BSA分析实操课程中qtlplot这个命令是一个脚本吗 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

问题 安装完虚拟机，导入文件之后发生这个错误

以前有人说是我的两个内存条不一样，后来只用电脑自带的也出现相同的情况。

问题 Mscanx染色体名称显示问题

共线性作图之后 染色体显示的名称是数字序号 而不是配置文件里的A01 A02。。。不通过修图软件 能否让图里的编号显示为配置文件里的编号？

问题 BSA实验到底怎么取样比较好？

近期想做个BSA实验，子代混池规模是50+50，导师让我每个子代提取一份DNA，然后混合成一个池测序，可是公司不愿意这么干，我想问下，这个是必须的吗？

问题 数据库里面没有对应格式

老师：       我想下载18年新出的基因组，里面只有gbff、bbs、fsa_nt,文件，文件内容和老师说的fna,faa,gff格式不一样，怎么解决呢，怎么弄成像fna,faa,gff里面的信息内容呢

问题 RNA-seq课程中的初始数据来源于哪篇文章

老师，请问RNA转录组分析的课程中，用于分析的初始人类normal/tumor/.fasta数据是来源于哪篇文献呀，可以提供下文献名吗？

问题 Tbtool中Quick Mscanx Wrapper使用的时候总是得不到结果

我按照简书上的基因家族分析步骤，分析两个物种的共线性。已经得到了merge的blast结果和gff结果，使用Quick Mscanx Wrapper的时候总是得不到结果，只能得到两个merge之的文件的副本。这是结果和参数图。

问题 mega建树

...，删除了几条短得没有比对到这部分的基因序列。这样就不准确了么。那短一点的序列该怎么建树呢？

文章 Pacbio三代无参全长转录组(Iso-Seq) 的转录本合并策略

...快，而且cd-hit这软件也是比较经典的一款软件，在转录组分析中经常用到     1.2     结果容易理解： 该软件就只是简单的基于序列的相似性，进行转录本的合并，转录本的ID都不会变动。 2. 缺点：     2.1    无法区分那...

问题 请问老师我下载了根，茎，叶，花，种子的转录组数据，怎么做成基因家族热图形式。

就是这样的图，我看分析流程根据方法下载了转录组数据，有作图的教程，没有说怎么结合基因家族分析，数据怎么处理。

文章 pheatmap绘制聚类热图

...准化原始数据中，每个基因表达变化范围对应的数值大小不同，导致图片中色彩变化难以显示基因在不同样本中的变化趋势，可以对基因在每个样本中基因表达数据进行标准化，使其数值在一定范围内，从而实现热图的优化，而...

问题 比较基因组共线性作图疑问

老师我在学习了咱们课程后可以做出两个物种的共线性图，但是我在看文献都是这种多个物种放在一起的图，我自己琢磨不明白是怎么做的，希望老师帮我解答

问题 问一个有关基因芯片的问题？

老师： 您好！我想做基因芯片方面的数据挖掘，是新手；但是看了一下芯片数据，探针对应的基因似乎不全，请问这种数据真的能使用吗？有价值吗？ 这是用R语言做的芯片图：

文章 NCBI下载的10X单细胞数据只有read1和read2如何读入cellranger

...mkfastq 产生，下面的例子是两个样本同一个lane测序拆分后分析；第二个例子是同一个样本两个lane测序，需要合并一起分析； 大家注意文件命名方式，蓝色和红色部分； cellranger命名规则 : https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene...

问题 关于共享文件夹的问题

按照教程进行，共享文件夹创建成功了，但是把拟南芥的fa文件复制进去之后我在power shell里用ll指令没有找到拟南芥的fa文件，请问这是怎么回事？使用ls指令也是只有显示文件夹不显示文件