问题 分化时间计算中的r值

老师，你好，请问计算中的r值是但双子叶不同，还是每个物种都不一样？？谢谢

问题 基因组注释问题

我在运行16.GeMoMa.sh,出现图1中的报错，我查看了database中gff文件，内容如图2，感觉不像是正常gff3文件的内容，图3是AI解答，是不是database中文件有错误？

文章 DIAMOND建库报错

...特殊字符，如下图所示： 需要检查蛋白序列文件，去掉不符合要求的序列。再次建库则不会报错。

问题 老师您好，问题是文中说到CPEB3 has a close positive correlation with cytotoxic cells, Th1 cells, and CD8 T cells（图a），为啥作者在正相关的一堆中提到了相关性不是最高的这三个，而在后面进一步分析中才提到TCM这中在图a中显示相关性最高的免疫细胞

问题 老师，以下是我的基因家族列表，基因组ID文件，基因家族泛基因列表，以及独有家族基因，下一步要做统计家族成员数量、排序及存在缺失分析，请老师帮忙看看，由于我的基因组名称中C01-C09，L01-L09,Q01-109还有另xiaomi等基因组名称与基因id命名对不上，该怎么修改，以上我没有自己修改内部任何内容

文章 变异结果 vcf 格式转换成 hapmap格式

基因组重测序数据分析视频课程： https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ 或者扫码二维码： 可以使用tassel GWAS分析软件 转换： perl /share/work/biosoft/tassel/tasseladmin-tassel-v5/run_pipeline.pl -Xms64G -Xmx64G -fork1 -vcf ../gwas_sub/snp.sorted.vcf -export ./hapm...

问题 TCGA数据下载

TCGA数据下载时，像HNSC这种癌症，我只需要口腔鳞状细胞癌这个部分，数据下载的时候，不能够增加一个“primary site”这个参数进行筛选吗？不行的话要怎么改写R代码才能够完成这个目的，如果可以的话，为什么会报错呢？

问题 请问虚拟机进不去咋办

好久没用了，今天想做个热图，小鲸鱼也打开了，输入进入虚拟机命令，发现进不去

文章 高分文章1

...-020-1969-6 02 2,658例癌症全基因组非编码体细胞驱动因素分析 文献：Analyses of non-coding somatic drivers in 2,658 cancer whole genomes 发表时间：2020.02 简介：分析了2,658个肿瘤基因组中非编码区的驱动点突变和结构变异。对于点突变开...

文章 遗传图谱构建基础知识

...图。 遗传图谱 定义 通过估算位点之间的重组率来估测不同标记在染色体上的相对位置或线性排列图。 理论基础 在细胞减数分裂时，非同源染色体上的基因相互独立、自由组合，同源染色体上的基因产生交换与重组，交换...

问题 rnaseq分析中片段inner size出现问题

片段inner size，片段选择是否异常 输入命令后：for i in DL125NS1 DL125NS2 DL125NS3 DL125PS1 DL125PS2 DL125PS3; do echo "RUN CMD: inner_distance.py -i $workdir/3.map/hisat2/${i}.bam  -r $GENE_BED  -o ${i}_inner_size" inner_distance.py -i $workdir/3.map/hisat2/${i}.bam  -r $GENE...

问题 circos图的名字显示问题

想在这个图片中的，多个名字来自于一大个点，距离较近，怎么配置啊，我的总是不显示完全，会有遮挡的 谢谢啊，没有金币了

问题 MCScanX画出的点图

老师，我想问一下为什么MCScanX画的点图与一些文献上的点图不一样呢？第一张是MCScanX画的，第二张是一些文献上的图。 十分感谢老师回答！！

问题 老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析，然而，运行镜像时一直出错，进不去，错误显示如下。

本地镜像导入：系统运行时

文章 为考研有多拼？——这位医学生给自己扎针醒脑！

...生考试还有50多天，在这个最后冲刺的阶段，你拼了没? 不知道大家有没有拼，反正这位同学是拼了： 图：来源于微博截图，侵删 “一天看书太久头晕胸闷，来两针能提神醒脑......还可以练习手法，为临床做准备。” 这么硬...