问题 老师您好，我做MCScanX 进行blast建库时总是报错，文件前加上绝对路径也还是报错显示文件不存在

文章 rgb函数选择颜色（并控制深浅）

...透明度，可以基于rgb()获取颜色，控制颜色深浅。 例如显示一下 红色： barplot(1,1,col="red")  当col="red"  或者col="#FF0000" 都是红色 而 rgb(255,0,0,255,maxColorValue=255) 也是红色，对应"#FF0000FF" rgb(red, green, blue, alpha, names = NULL, maxColorVa...

问题 重测序中两个GATK运行都失败，显示如下代码和图片，麻烦老师进行解答

Error: LinkageError occurred while loading main class org.broadinstitute.hellbender.Main         java.lang.UnsupportedClassVersionError: org/broadinstitute/hellbender/Main has been compiled by a more recent version of the Java Runtime (class file version 61.0), this version of the Java Runtime ...

问题 基因家族分析时，提取cds与pep序列报错显示 no sequence

Error, no sequence for Scaffold1 at /share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl line 84. 应该如何解决？代码与报错如下， 我的基因组gff文件是这样的，我看课程示例文件是ID=XX;Parent=xx,是因为这个才提取不出来吗

文章 文献图片检索工具-Openi，用图片检索文献！

...括题目、作者、图注，只需将鼠标悬停在图片上就会自动显示以上信息。 点击图片则会进一步详细展示以上信息，并且可以看到该文献的摘要内容，方便大家快速了解文章内容。 4. 检索结果还可以更改展示样式，如下图，以...

问题 HMM搜素后显示No targets detected that satisfy reporting thresholds，生成的文件没有候选基因

检查过下载的HMM模型和蛋白序列都没有问题 生产的文件是这样的

问题 补充细节： 运行WGCNA代码后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总显示文件大小为0

...运行脚本后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总是显示 文件大小为0，打开时显示“格式错误，文件已损坏”。请问这该怎么解决呢？非常感谢 老师，我刚重新运行后，看到错误提示是：Error in dev.off(): internal read in PDF_end...

问题 ka/ks利用课程脚本输出了一对完全一样的串联重复基因但mcsacnX做图时为啥没显示串联重复基因

问题 这里显示没有安装解释器，不能新建文件夹，这是怎么回事？就在官网下载的解释器呀，这是咋回事？

问题 成功启用镜像后，目录下的文件可以查看到，大小也是正确的，但是total显示为0，如何解决这个问题？

文章 进化树中bootstrap值设置

...在线软件在进化树修饰方面非常出色。在设置Bootstrap值的显示方式上也是非常的优秀。 设置方法 1.使用进化树“(A:0.1,(B:0.2,(C:0.3,(D:0.4,E:0.5)40:0.6)80:0.05)100:0.1)90:0.43;”进化树必须含有bootstrap值。 2.点击 “Basic > show/hide bootstr...

文章 一文教你转录组数据如何挖、文章怎么写！

...期小麦穗中基因表达的变化情况及其调控机制。如下图，显示不同时期的麦穗的发育情况。 结果内容 基于小麦穗发育的6个时期，分别采样并进行转录组测序，下面我们一起看一下作者是如何从海量数据里层层筛选的！ 1. 首...

问题 请问一下在做mcscan分析的时候pep.fa文件里只有3w多条蛋白序列，后面得到的AT.collinearity文件里显示9w多基因是什么意思啊？

请问一下在做mcscan分析的时候pep.fa文件里只有3w多条蛋白序列，后面得到的AT.collinearity文件里显示9w多基因是什么意思啊？

问题 老师好，我已经导入了虚拟光驱，但还是显示不行，重新弄了好几次都是这样，请问这是为什么呢？

问题 老师您好，我在circos作图时，显示基因基因数目超出最大值怎么办呢？max_link要怎么设置呀？