...可视化工具，帮助研究人员解释小RNA测序实验的结果。这可以包括集群图和其他数据的图形表示。 兼容性： SeqCluster 通常与常见的小RNA测序数据格式兼容，因此适用于各种测序平台生成的数据。 conda安装seqcluster软件： conda c...
老师您好，返回来的数据说是双端测序，但是sra转为fq文件只有一个，询问得知是合并了之后。这个要怎么处理，没办法生成脚本里面的qza和qzv文件
...重新安装系统，后一个是子节点网络启动直接进入系统。这个可在集群断电 之后子节点重启直接进入grub的情况下使用。 批量重新安装 与重启 # rocks set host boot compute action=install # rocks run host compute "shutdown -r now" 删除节点 # r...
...些活性物质，蛋白质，RNA，等等会通过韧皮部从砧木运输到接穗从而影响接穗的生理生化等代谢活动，具体主要影响的方面如下： Primary metabolites Amino acids Sugars Sugar Phosphates Organic acids Fatty acids Polyols Secondary metabo...
按照脚本跑完这个指令后我的id list并没有像demo里面那样多个mRNA对应于一个geneID的结果，而是一堆转录本在同一行显示出来了，请问为什么会这样 #去除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的代表，此步...
这个需要了解一下TCGA的样品编码方式（barcode）: 其中sample 指示的位置，标记了不同的样品类型，具体如下表所示： 01 Primary Solid Tumor TP(实体瘤）02 Recurrent Solid Tumor TR03Primary Blood Derived Cancer - Peripher...
... 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂...
...不建议使用ai,但是如果你像我一样有的东西忘记掉了,那可以问一下ai 虽然有点波折,但是最终完成了任务,我去网上找到了v2区域的引物,构建了我的分类器
...s.BAMIndexer.processAlignment(BAMIndexer.java:89) ... 5 more 可以在运行时加入--create-output-bam-index false 选项，不让它创建bam文件的索引文件。 /share/work/biosoft/GATK/gatk-4.2.2.0/gatk --java-options "-XX:ParallelGCThreads=5 -Xmx50g " SplitNCigarReads -R /sh...
...e: get_id_fqgz.py [-h] input_fastq_gz output_file2，使用perl脚本根据这个id文件和原始数据生成所需的cleandatause Bio::SeqIO; use Bio::Seq; use Term::ProgressBar; if (@ARGV == 3) { my ($id_file, $fq1_file, $out1_file) = @ARGV; filter_fastq($id_file, $fq1_file, $out1_file)...
...OC105388771;gbkey=Gene;gene=LOC105388771;gene_biotype=protein_coding31569 这个最后一个数值和信号强弱有关系吗？
...上面有区别哦 2：在vim文件中如何退出 a、Escb、ctrl+；#可以加上 如：wqc、q #其中q表示退出，q!#表示强制退出 2：下载软件 wget +链接 3：cat命令 一次性显示整个文件的内容 cat+file.name+|+tac#表示事先在文件file.name中上下...
如何可以补充青色的基因模块，并生成导入Cytoscape的两个文件
您好我用的csv文件 文件格式如下 ，这个是包里自带的数据集我转成csv了 源数据是cel我该怎么办 > library(rbsurv)> setwd("C:/Users/Administrator/Desktop")> Mydata<-read.table(file = "C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\gliomaSet.txt",header=TRUE)>...